机构合并撤销后，负责人的待遇问题主要取决于合并或撤销的具体方案、相关法律法规以及负责人与原机构之间的劳动合同或聘用协议的约定。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、合并或撤销方案中的待遇规定
合并方案：如果机构是通过合并的方式进行重组，那么合并后的新机构通常会继承原机构的权利和义务，包括与员工签订的劳动合同。在这种情况下，负责人的待遇（如薪资、福利、职位等）可能会根据合并方案中的具体规定进行调整。如果合并方案中明确规定了负责人的待遇不变或有所提升，那么负责人就有权按照方案享受相应的待遇。
撤销方案：如果机构是被撤销而非合并，那么负责人的待遇问题就需要根据撤销方案中的规定来处理。撤销方案可能会规定负责人的安置方式，如提供新的工作岗位、支付经济补偿等。如果撤销方案中没有明确规定负责人的待遇问题，那么就需要参考相关法律法规和劳动合同或聘用协议的约定。
二、相关法律法规的规定
劳动合同法：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位在变更、解除或终止劳动合同时，应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致、诚实信用的原则。如果机构合并或撤销导致负责人的劳动合同需要变更或解除，那么用人单位应当与负责人进行协商，并按照法律规定支付相应的经济补偿。
公司法及相关法规：对于公司制机构，其合并或撤销还需要遵守《中华人民共和国公司法》及相关法规的规定。这些法规可能涉及公司合并或撤销的程序、债权债务的承接、员工安置等方面的问题，对负责人的待遇问题也可能产生间接影响。
三、劳动合同或聘用协议的约定
合同内容：负责人与原机构签订的劳动合同或聘用协议中，通常会包含关于待遇、职位、工作内容等方面的约定。如果机构合并或撤销导致这些约定需要变更或解除，那么双方应当按照合同中的约定进行处理。如果合同中没有明确规定，那么就需要参考相关法律法规和行业惯例。
协商变更：在机构合并或撤销的情况下，负责人与新机构或原机构的上级单位可以通过协商的方式变更劳动合同或聘用协议中的相关条款，以明确负责人的待遇问题。协商过程中，双方应当遵循公平、合理的原则，确保负责人的合法权益得到保障。
四、实际操作建议
了解合并或撤销方案：负责人应当首先了解机构合并或撤销的具体方案，包括待遇、职位、工作内容等方面的规定。这有助于负责人明确自己的权益和义务，为后续的协商和处理提供依据。
审查劳动合同或聘用协议：负责人应当仔细审查自己与原机构签订的劳动合同或聘用协议，了解其中关于待遇、变更、解除等方面的约定。如果合同中有不明确或存在争议的地方，可以及时与用人单位进行沟通或咨询专业律师。
积极协商：在机构合并或撤销的过程中，负责人应当积极与用人单位进行协商，就待遇问题达成一致意见。如果协商无果，负责人可以依法向劳动争议调解仲裁机构申请调解或仲裁，维护自己的合法权益。
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