在机动车与非机动车发生交通事故且双方负有同等责任的情况下，赔偿问题确实需要依据相关法律法规及实际情况来综合处理。以下是我为您详细梳理的赔偿流程与原则：
一、赔偿原则
首先，根据《中华人民共和国道路交通安全法》第七十六条，机动车发生交通事故造成人身伤亡、财产损失的，应由保险公司在机动车第三者责任强制保险（即交强险）责任限额范围内先行赔偿。对于超出交强险赔偿限额的部分，双方则根据各自的过错程度来分担损失，由于双方是同等责任，所以一般情况下，机动车一方会承担60%的赔偿责任，非机动车一方承担40%的责任，但具体比例可能因地区而异。
二、赔偿项目与计算方式
医疗费用：
- 包括挂号费、检查费、治疗费、药费等实际产生的费用。
- 先由交强险在医疗费用赔偿限额（1.8万元）内赔偿，超出部分再按责任比例分担。
财产损失：
- 包括车辆维修费用、车载物品损失等。
- 若非机动车方财产损失不超过2000元，这部分费用在交强险范围内赔付；超出部分，双方各承担50%。
- 对于机动车方的维修费用，非机动车方也需承担相应比例（一般为50%）。
伤残赔偿：
- 如果事故造成非机动车方伤残，需根据伤残等级计算残疾赔偿金等相关费用。
- 这些费用先在交强险限额内赔付，超出部分由双方按同等责任比例分担。
其他费用：
- 如误工费、护理费、交通费、住院伙食补助费等，也需根据实际情况和责任比例进行赔偿。
- 这些费用同样先由交强险赔付，超出部分按责任比例分担。
三、赔偿流程
协商：
- 事故发生后，双方应首先尝试通过友好协商解决赔偿事宜。
- 可以就赔偿金额、支付方式等具体细节进行协商，并尽量达成书面协议。
调解：
- 若协商不成，可以寻求第三方调解机构的帮助，如交通管理部门或人民调解委员会。
- 调解机构将协助双方进行沟通，提出合理的赔偿方案，并促成双方达成一致意见。
诉讼：
- 若调解仍无法解决争议，任何一方均有权向人民法院提起诉讼。
- 法院将根据事实和法律规定作出判决，确定双方的赔偿责任和赔偿金额。
四、特殊情况与注意事项
- 非机动车方故意碰撞：如果非机动车一方存在故意碰撞机动车等情形，机动车一方不承担赔偿责任。但这种情况需要有充分的证据来证明非机动车方的故意行为。
- 保留证据：在处理赔偿问题时，务必保留好相关证据，如医疗记录、费用清单、收入证明、车辆维修发票等。这些证据将有助于支持您的赔偿请求，并在必要时作为法律依据。
- 了解保险情况：确认对方是否购买了交强险和商业三者险，以及保险的具体条款和赔偿限额。这有助于您更准确地评估自己的赔偿权益，并在必要时向保险公司提出索赔请求。
- 及时咨询专业律师：如果您对赔偿问题存在疑问或不确定如何处理，建议及时咨询专业律师的意见。律师将根据您的具体情况提供有针对性的法律建议和指导，帮助您更好地维护自己的合法权益。
综上所述，机动车与非机动车发生交通事故且双方负同等责任时的赔偿方式是一个综合考量的过程。双方应依法依规进行赔偿，确保自身合法权益得到保障。希望这些信息能对您有所帮助。