结论：事业单位工勤人员转干部后，将职工薪级工资相应调降两级是否违规，不能一概而论，需结合具体情况判断。以下从不同角度进行分析：
从法律法规角度：
- 事业单位工作人员的工资调整通常需遵循国家及地方的相关法律法规和政策规定。若相关法律法规或政策明确规定了工勤人员转干部后薪级工资的调整方式，且调降两级与这些规定不符，则此行为可能构成违规。
- 例如，如果某地区或某部门有明确规定，工勤人员转干部后薪级工资应保持不变或按一定比例上调，而实际却调降了两级，那么这种行为就违反了相关规定。
从单位内部规章制度角度：
- 事业单位内部通常会有自己的规章制度，包括工资调整、职务晋升等方面的规定。如果单位内部规章制度中明确规定了工勤人员转干部后薪级工资的调整方式，且调降两级符合这些规定，那么此行为可能不构成违规。
- 但需要注意的是，单位内部规章制度不能违反国家法律法规和政策规定。如果单位规章制度与法律法规相冲突，应以法律法规为准。
从合理性角度：
- 即使法律法规和单位规章制度没有明确规定工勤人员转干部后薪级工资的调整方式，调降两级也可能因缺乏合理性而构成不当行为。
- 合理性判断需考虑多种因素，如转岗后的工作职责变化、工作能力要求提升、市场薪酬水平等。如果调降薪级工资与这些因素不符，且没有合理的解释和依据，那么这种行为可能被视为不合理。
建议：
- 对于事业单位工勤人员转干部后薪级工资调降两级的情况，建议首先查阅相关法律法规和政策规定，以及单位内部规章制度，了解具体的工资调整方式和标准。
- 如果认为调降薪级工资的行为可能违规或不合理，可以向单位人事部门或相关部门提出异议，并要求给出合理的解释和依据。
- 如果问题无法得到妥善解决，可以考虑向劳动监察部门投诉或寻求法律援助，以维护自己的合法权益。
可能后果：
- 如果调降薪级工资的行为确实违规或不合理，且未得到及时纠正，可能会引发劳动争议或法律纠纷，对单位和个人都造成不良影响。
- 因此，建议单位在调整员工工资时，务必遵循相关法律法规和政策规定，以及单位内部规章制度，确保工资调整的合法性和合理性。