结论前置：在检察院对交通肇事案件作出不起诉决定的情况下，一般情况下是可以开具无犯罪记录证明的，但具体还需根据不起诉的类型和当地的具体规定来判断。
一、不起诉的类型及其法律效果
绝对不起诉：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第十六条，若交通肇事行为属于情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；或者已过追诉时效期限；或经特赦令免除刑罚等情形，检察院将作出绝对不起诉决定。
- 在这种情况下，行为人从法律意义上没有构成犯罪，因此可以开具无犯罪记录证明。
相对不起诉：
- 依据《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百七十七条第二款，对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出相对不起诉决定。
- 相对不起诉的前提是行为人已经构成犯罪，只是因情节轻微等原因未起诉。在这种情况下，严格意义上不能开具无犯罪记录证明，因为行为人已构成犯罪。然而，实践中各地对于相对不起诉能否开具无犯罪记录证明的规定和操作存在差异，需根据当地具体规定来判断。
存疑不起诉：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百七十五条第四款，对于二次补充侦查的案件，若人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件，应作出存疑不起诉决定。
- 存疑不起诉是因证据问题无法定罪，从法律角度不能认定行为人犯罪。因此，这种情况下通常可以开具无犯罪记录证明。
二、交通肇事案件的特殊处理
- 在交通肇事罪中，若犯罪嫌疑人真诚悔罪、赔偿损失并取得谅解，检察机关可根据具体情况决定不起诉。
- 依据《中华人民共和国刑法》第一百三十三条，若交通事故未构成犯罪或检察院不起诉，则当事人没有犯罪记录，可开具无犯罪记录证明。
三、实际操作中的注意事项
地区差异：
- 不同地区对于不起诉后能否开具无犯罪记录证明的规定可能存在差异。因此，在申请前最好先了解当地的具体规定。
申请流程：
- 通常，无犯罪记录证明由公安机关出具。在申请时，需要提供个人身份证明、检察院的不起诉决定书等相关材料。
法律后果：
- 即使获得了无犯罪记录证明，也不意味着行为人完全摆脱了法律责任。例如，在交通肇事案件中，行为人可能仍需承担民事赔偿责任或接受行政处罚。
四、建议与总结
- 建议：在检察院作出不起诉决定后，若需要开具无犯罪记录证明，最好先咨询当地公安机关或律师，了解具体的申请流程和所需材料。
- 总结：交通肇事检察院做出不起诉决定后，能否开具无犯罪记录证明主要取决于不起诉的类型和当地的具体规定。在大多数情况下，绝对不起诉和存疑不起诉的情况下可以开具无犯罪记录证明，而相对不起诉的情况则可能因地区和具体规定而异。因此，在申请前最好先了解当地的具体规定和申请流程。
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