国有独资公司在撤销董事会后，董事会秘书的安排需根据公司的实际情况、相关法律法规以及公司章程的规定来综合确定。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 法律法规依据：

   • 根据《中华人民共和国公司法》及相关规定，国有独资公司不设股东会，由国有资产监督管理机构行使股东会职权。董事会作为公司的决策机构，其设立与撤销需遵循法定程序。当董事会被撤销时，公司需重新审视其组织架构，包括董事会秘书的职位安排。
   • 董事会秘书作为公司的高级管理人员，其职责通常包括负责公司股东大会和董事会会议的筹备、文件保管以及公司股东资料的管理等。在董事会撤销后，这些职责可能需要由其他部门或人员来承接。

2. 公司章程与内部规定：

   • 公司章程是公司治理的基本准则，其中可能包含关于董事会秘书的任命、职责、解聘等条款。在董事会撤销后，公司应首先查阅公司章程，看是否有关于此情况的具体规定。
   • 如果公司章程没有明确规定，公司可以依据内部管理制度和实际情况，制定临时或长期的安排方案。

3. 可能的安排方案：

   • 转岗安排：如果董事会秘书具备其他部门所需的专业技能和经验，公司可以考虑将其转岗至其他部门，如法务部、证券部或综合管理部等，继续发挥其专业优势。
   • 解聘与补偿：如果公司决定不再设立董事会秘书职位，或者董事会秘书不愿意接受转岗安排，公司应按照相关法律法规和公司章程的规定，与其解除劳动合同，并支付相应的经济补偿。
   • 临时安排：在董事会撤销初期，公司可能尚未确定新的组织架构和人员安排。此时，可以临时指定一名或多名人员负责原董事会秘书的部分或全部职责，以确保公司运营的连续性和稳定性。

4. 注意事项：

   • 在进行任何安排前，公司应确保所有决策都符合相关法律法规和公司章程的规定，避免引发法律纠纷。
   • 公司应与董事会秘书进行充分沟通，了解其意愿和诉求，尽量达成双方都能接受的安排方案。
   • 如果董事会秘书是公司的重要管理人员，其离职可能对公司产生一定影响。因此，公司应提前做好应对准备，确保公司运营的平稳过渡。

建议：国有独资公司在撤销董事会后，应尽快召开相关会议，讨论并确定董事会秘书的安排方案。同时，公司应密切关注相关法律法规的变化，确保所有决策都符合最新要求。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。