结论：克扣除夕、初一、初二三天的工资是否算作扣工资，需根据具体情况判断，若这三天属于法定节假日且员工正常休假，则单位克扣工资违法；若这三天不属于法定节假日或员工未正常休假，则需进一步分析单位行为是否合法。

分析如下：

1. 法定节假日的工资支付规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，法定节假日（包括新年、春节、清明节、劳动节、端午节、中秋节和国庆节等）安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。若员工在法定节假日正常休假，则单位应按照正常工资标准支付工资，不得克扣。
   • 除夕、初一、初二通常属于春节的法定节假日范畴（具体以当年国家发布的节假日安排为准）。若这三天属于法定节假日，且员工正常休假，则单位克扣这三天工资的行为违法。

2. 非法定节假日的工资支付情况：

   • 若除夕、初一、初二中的某一天或几天不属于法定节假日，而是单位根据自身情况安排的休假或调休，且员工未提供劳动，则单位可能无需支付这期间的工资，或者按照双方约定的标准支付（如带薪年休假等）。但这种情况需具体看单位规章制度或劳动合同中的约定。
   • 若员工在这三天中提供了劳动，但单位未按照法律规定支付加班费或正常工资，则单位的行为同样违法。

3. 员工未正常休假的情况：

   • 若员工因工作需要未能在除夕、初一、初二正常休假，而是加班工作，则单位应按照《劳动法》的规定支付不低于工资百分之三百的加班费。若单位未支付或克扣加班费，则属于违法行为。

建议：

• 核实节假日安排：首先确认除夕、初一、初二是否属于当年的法定节假日。这可以通过查阅国家发布的节假日安排或咨询当地劳动部门来确认。
• 检查单位规章制度：查看单位规章制度或劳动合同中关于节假日工资支付的规定，了解单位在这方面的具体做法。
• 与单位沟通：若认为单位克扣了工资，可以与单位的人力资源部门或财务部门进行沟通，了解克扣工资的具体原因和依据。
• 寻求法律援助：若沟通无果，且认为单位的行为确实违法，可以向当地劳动监察部门投诉或寻求法律援助，通过法律途径维护自己的合法权益。

可能后果：

• 若单位克扣法定节假日工资或加班费，可能面临劳动监察部门的处罚，包括责令支付工资、加班费及赔偿金等。
• 员工也有权通过劳动仲裁或诉讼等法律途径要求单位支付被克扣的工资及相应的经济补偿。