结论：根据您描述的情况，若每月应发工资为3000元，但因8号上班且按规定休假3天后实际发放2000元，这一做法是否合规需结合具体法律规定和实际情况来判断，一般情况下，若扣除部分无法定依据，则不合规。以下从多个角度进行分析：
一、工资计算的基本原则
根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，除非有法定或约定的扣除情形，否则用人单位应当全额支付劳动者应得的工资。
二、应发工资与实发工资的差异
- 应发工资：即劳动者在一个月内应得的全部工资，包括基本工资、奖金、津贴等。
- 实发工资：即劳动者实际收到的工资，可能会因各种扣除（如社保、个税、罚款等）而少于应发工资。
三、您的情况分析
若扣除部分无法定依据：
- 如果您8号上班且按规定休假3天，并没有导致您违反公司规章制度或造成公司损失，那么公司扣除您1000元工资的做法可能缺乏法律依据。
- 在这种情况下，公司应当按照您的应发工资3000元全额支付，实际发放2000元则不合规。
若扣除部分有法定或约定依据：
- 如果公司能够证明扣除的1000元工资是基于法定或约定的扣除情形（如您因个人原因造成公司损失、违反公司规章制度等），并且扣除的金额合理，那么公司的做法可能是合规的。
- 但需要注意的是，即使存在扣除情形，扣除的金额也应当合理，且不得违反相关法律法规的规定。
四、建议与行动
与公司沟通：
- 首先，建议您与公司的人力资源部门或相关负责人进行沟通，了解扣除工资的具体原因和依据。
- 如果公司无法提供合理的解释或依据，您可以进一步表达您的异议和诉求。
申请劳动仲裁：
- 如果与公司沟通无果，您可以向当地的劳动仲裁机构申请劳动仲裁，要求公司支付被扣除的工资。
- 在申请劳动仲裁时，您需要提供相关证据（如工资条、考勤记录、公司规章制度等）来支持您的诉求。
咨询专业律师：
- 如果您对劳动仲裁流程或相关法律法规不熟悉，可以向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议和帮助。
五、法律依据
- 《中华人民共和国劳动法》第五十条：“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。”
- 《工资支付暂行规定》第十五条：“用人单位不得克扣劳动者工资。有下列情况之一的，用人单位可以代扣劳动者工资：（一）用人单位代扣代缴的个人所得税；（二）用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用；（三）法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费；（四）法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。”
最后，希望以上分析能够对您有所帮助。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。