核心结论：机关事业单位退休办理晚了两年，可能会涉及养老金补发、工龄认定以及可能产生的滞纳金或利息等问题，具体处理方式需根据实际情况来确定。以下分情况详细说明：

1. 养老金补发问题

   • 情况说明：如果因为单位原因导致退休办理晚了两年，那么在这两年期间，您本应领取的养老金可能会被积压。
   • 处理方式：一般来说，单位需要向社保部门申请补发这两年期间的养老金。您需要与单位沟通，确保单位及时为您办理养老金的补发手续，并关注补发进度，确保养老金能够足额、及时地发放到您的账户。

2. 工龄认定问题

   • 情况说明：退休办理晚了可能会影响工龄的认定，进而影响养老金的数额。工龄是计算养老金的重要因素之一，工龄越长，养老金一般越高。
   • 处理方式：您需要向单位提供相关的证明材料，如工作记录、考勤记录等，以证明您在这两年期间确实在工作，并应计入工龄。单位会根据这些材料向社保部门申请调整您的工龄认定，从而确保您的养老金数额准确无误。

3. 滞纳金或利息问题

   • 情况说明：如果因为单位原因导致退休办理延误，且这期间涉及到社保费用的缴纳问题，那么可能会产生滞纳金或利息。
   • 处理方式：您需要与单位沟通，了解是否产生了滞纳金或利息，并明确这些费用的承担方。一般来说，如果是因为单位的原因导致的延误，那么这些费用应由单位承担。如果单位拒绝承担，您可以向相关部门投诉或寻求法律援助。

4. 其他注意事项

   • 保留证据：在整个处理过程中，您需要保留好相关的证据材料，如与单位的沟通记录、工作记录、社保缴纳记录等，以备不时之需。
   • 及时咨询：如果您在处理过程中遇到任何问题或疑问，可以及时向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。

总结建议：机关事业单位退休办理晚了两年是一个比较复杂的问题，涉及到多个方面的法律权益。我建议您首先与单位进行沟通，了解具体情况并尝试协商解决。如果协商无果，您可以考虑向相关部门投诉或寻求法律援助。在整个处理过程中，请务必保留好相关证据材料，并及时咨询专业律师以维护自己的合法权益。