当您的父亲去世后，他注册的店铺（即个体工商户）的处理方式需要遵循一定的法律程序和规定。以下是我为您详细梳理的步骤和建议：

一、理解个体工商户营业执照的性质

个体工商户营业执照是行政机关颁发给特定自然人的一种行政许可，它具有高度人身依附属性，并不属于可继承的财产范畴。因此，您无法直接通过诉讼方式继承您父亲名下的个体工商户营业执照或经营权。

二、继承人想继续经营的处理方式

如果您作为继承人希望继续经营您父亲名下的店铺，虽然无法直接继承营业执照，但您可以向市场监督管理部门提交相关材料申请变更经营者。这一过程需要遵循《个体工商户登记管理规定》的相关规定。

1. 准备材料：

   • 您需要准备您父亲的死亡证明、您的身份证明、以及您与您父亲之间的继承关系证明（如户口本、公证书等）。
   • 如果存在多个继承人，您需要确保所有继承人就继任经营者或注销登记申请人达成一致意见，并可能需要提供公证机构出具的公证文书。

2. 提交申请：

   • 携带上述材料前往您父亲店铺所在地的市场监督管理部门（如工商局）提交变更经营者的申请。
   • 填写相关的申请表格，并按照要求缴纳可能产生的费用。

3. 等待审核：

   • 市场监督管理部门会对您的申请进行审核，确认您是否满足变更经营者的条件。
   • 审核过程中，您可能需要配合提供额外的材料或信息。

4. 领取新营业执照：

   • 如果审核通过，您将获得新的个体工商户营业执照，上面将登记您的名字作为新的经营者。

三、注意事项

1. 多个继承人的情况：

   • 如果存在多个继承人，且无法就继任经营者或注销登记申请人达成一致意见，那么您可能无法直接申请变更经营者。在这种情况下，您可能需要通过协商、调解或诉讼等方式解决继承纠纷。

2. 公证的作用：

   • 在多个继承人的情况下，公证机构可以出具公证文书，证明继承人之间就继任经营者或注销登记申请人达成的一致意见。这有助于确保登记的合法性和有序性，避免纠纷。

3. 及时办理：

   • 建议您在您父亲去世后尽快处理店铺的变更或注销事宜，以避免因长时间未处理而导致的额外麻烦和损失。

四、其他选择

如果您不希望继续经营店铺，或者无法满足变更经营者的条件，您也可以选择注销该个体工商户。注销过程同样需要向市场监督管理部门提交相关材料，并按照规定办理注销手续。

希望以上解答能够帮助您清晰地了解处理父亲去世后注册店铺的相关流程和注意事项。如果您在处理过程中遇到任何问题或需要进一步的帮助，请随时咨询当地的市场监督管理部门或专业律师。