关于您提出的“让员工签社保最低档缴费协议是否合法”的问题，这需要从多个法律层面进行详细分析。
首先，我们必须明确的是，根据《中华人民共和国劳动法》第七十二条和《中华人民共和国社会保险法》第五十八条的规定，用人单位和劳动者必须依法参加社会保险，并缴纳社会保险费。这是用人单位的法定义务，具有强制性，不能通过私下协议来免除或减轻。
接下来，我们分析这种协议的合法性：
协议内容与法律强制性规定的冲突：
- 如果协议中规定用人单位只按最低档为员工缴纳社保，而实际上这低于了法律规定的应缴标准，或者用人单位试图通过这种方式来逃避其应承担的社保缴纳责任，那么这样的协议是违法的，不具有法律效力。
协议的实际执行效果：
- 即使协议在文字上表述得看似合法，但如果其实际执行效果是导致用人单位未履行其法定的社保缴纳义务，或者员工因未缴纳足额社保而遭受损失，那么用人单位仍然需要承担相应的法律责任。
员工的权益保障：
- 员工有权享受法律规定的社保待遇，包括养老保险、医疗保险、失业保险等。如果用人单位通过协议方式降低社保缴纳标准，实际上是在剥夺员工的这些合法权益。
此外，我还想提醒您注意以下几点潜在风险：
- 对员工的风险：员工虽然可能因协议而获得某些短期利益，但长期来看，他们将失去社保的全面保障，面临工伤、疾病、失业等风险时将无法享受相应待遇。
- 对用人单位的风险：即使签订了这样的协议，用人单位在员工要求补缴社保时仍有义务补缴。同时，如果因未缴纳社保给员工造成损失，用人单位需要承担赔偿责任，并可能面临社保行政部门的处罚。
综上所述，让员工签社保最低档缴费协议是不合法的，因为它违反了法律的强制性规定，并可能损害员工的合法权益。作为用人单位，应遵守法律规定，履行其法定的社保缴纳义务。同时，员工也应了解自身的社保权益，不要轻易放弃或妥协。在签订任何相关协议前，建议双方都咨询专业法律顾问，以确保协议的合法性和有效性。