在农业设施用地上建冷库是否合法，主要取决于是否符合当地规划、土地用途管制、是否取得必要许可和审批，以及是否满足安全和环保要求等多个因素。以下是对这些因素的详细分析：
一、符合规划和土地用途管制
土地用途管制：
- 根据《中华人民共和国土地管理法》，国家实行土地用途管制制度，将土地分为农用地、建设用地和未利用地。农业设施用地通常属于农用地范畴，主要用于农业生产活动。
- 若要在农业设施用地上建冷库，必须确认该地块是否符合土地利用总体规划，并已通过法定程序转为建设用地（如果冷库建设需要改变土地性质的话）。不过，根据自然资源部、农业农村部的相关政策，冷库作为农产品仓储保鲜的重要设施，被明确纳入设施农业用地的范畴，这意味着在符合一定条件下，可能不需要将土地性质完全转为建设用地。
规划要求：
- 建设冷库需符合当地土地利用总体规划和农业发展规划。确保项目选址不占用永久基本农田，并尽量利用低效闲置土地或未利用地。
二、取得必要许可和审批
审批手续：
- 在农业设施用地上建冷库，通常需要向当地乡镇政府或相关部门提交设施农业用地建设申请，包括项目名称、建设地点、用地规模、建设内容等信息。
- 乡镇政府会组织相关部门进行实地踏勘和审核，确认项目符合规划要求和政策规定后，予以备案。部分地区可能需要办理农用地转用审批手续（如果冷库建设需要改变土地性质），具体以当地规定为准。
其他许可：
- 根据冷库的具体用途，可能还需要办理营业执照（若涉及商业经营）、食品经营许可证（若用于存储食品）、特种设备登记和检验（若涉及特种设备管理）等。
三、满足安全和环保要求
消防安全：
- 冷库的建设和使用需符合消防安全标准。确保电线布局合理、设置防火分隔等，以防止火灾事故的发生。
环保要求：
- 冷库运行过程中可能产生噪音、废水、废气等污染物，需采取有效措施防治污染，确保符合环保相关法律法规的要求。
四、违法后果
- 若未依法办理审批手续、违反土地利用总体规划或破坏耕地资源，在农业设施用地上建冷库将构成违法行为。可能面临土地收回、罚款等行政处罚。
- 在严重情况下，如果非法占用耕地数量较大且造成耕地大量毁坏，还可能构成非法占用农用地罪，被依法追究刑事责任。
五、操作建议
- 咨询当地部门：在决定在农业设施用地上建冷库之前，务必咨询当地土地管理部门和建筑规划部门，了解相关法规要求和审批流程。
- 准备必要材料：根据当地要求准备所有必要的申请材料，包括项目可行性报告、用地协议、环保评估报告等。
- 确保合规建设：在建设过程中应严格遵守相关法律法规和技术标准，确保冷库的安全性和合规性。
综上所述，农业设施用地上建冷库的合法性取决于多个因素的综合考量。只有依法办理审批手续、符合土地利用总体规划并满足安全和环保要求的前提下，才能进行合法的冷库建设。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。