在农村自建房内建冷库是否合法，需视具体情况而定。以下从不同角度为您详细分析：
一、土地利用规划角度
符合土地利用规划：若自建房所在的土地属于集体建设用地，且符合当地的土地利用规划，那么在该土地上建设冷库通常是合法的。这要求您向当地土地管理部门申请建设用地，并取得相关的审批手续，如建设工程规划许可证等。
违反土地利用规划：如果自建房所在的土地是基本农田或其他受严格保护的农用地，那么在该土地上建设冷库通常是不合法的。因为基本农田不得用于非农业建设，违反土地用途管制规定，建设行为可能被认定为违法，面临土地收回、罚款等处罚。
二、审批手续角度
经过审批：在建设冷库前，您需要确保已经获得了所有必要的审批手续。这包括但不限于土地使用审批、建设工程规划许可、环保审批等。只有经过这些审批，您的建设行为才是合法的。
未经审批：如果您未经审批就擅自建设冷库，那么您的行为可能构成违法建设。这可能导致您面临责令限期改正、拆除等处罚。
三、环保与安全角度
符合环保要求：在建设与运营冷库的过程中，您需要采取有效的污染防治措施，避免对周边环境造成污染。例如，妥善处理制冷设备产生的噪声、废水等污染物，确保符合环保标准。
符合安全要求：冷库的建设与运营还需要符合消防安全、结构安全等标准规范。您需要配备必要的消防设施，确保冷库结构稳固，能承受相应荷载。如果冷库在建设或运营过程中存在安全隐患，那么您的行为可能构成违法，面临相应的法律责任。
四、实际操作建议
咨询当地部门：在决定建设冷库前，建议您先咨询当地土地管理部门、规划部门、环保部门等相关机构，了解具体的土地利用规划、审批手续要求以及环保与安全标准。
准备相关材料：根据咨询结果，准备相关的申请材料，如土地使用申请、建设工程规划许可申请、环保审批申请等。
遵循审批流程：按照当地部门的审批流程，逐步完成审批手续。在审批过程中，保持与相关部门的沟通，及时解决审批过程中出现的问题。
总结来看，农村自建房内建冷库的合法性取决于多个因素，包括土地利用规划、审批手续、环保与安全要求等。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。