结论：业委会与物业公司合同约定公共收益归物业公司以弥补物业费不足，这一做法是否违法违规，需结合具体情况判断，不一定违法违规。以下从不同角度进行分析：
一、法律背景与规定
公共收益的归属：
- 根据《物业管理条例》及相关规定，小区公共收益（如电梯广告费、公共场地停车费等）原则上归全体业主共有。这部分收益应当主要用于补充专项维修资金，也可以按照业主大会的决定使用。
物业费的收取与使用：
- 物业费是物业公司为业主提供物业服务而收取的费用，其使用应当遵循合同约定和相关法律法规的规定，主要用于物业共用部位、共用设施设备的日常运行、维护费用等。
二、合同约定的合法性分析
合同自由原则：
- 在民事法律关系中，合同双方享有合同自由，即可以在不违反法律、行政法规强制性规定的前提下，自由约定合同内容。因此，业委会与物业公司之间就公共收益的分配进行约定，本身并不违反合同自由原则。
合法性判断：
- 若合同约定合法：如果业委会与物业公司的合同约定是在遵循相关法律法规、尊重业主权益的基础上进行的，且经过了业主大会的同意或授权，那么这种约定可能是合法的。例如，在物业费标准较低、物业公司运营困难的情况下，为了保障物业服务的持续性和质量，业委会与物业公司协商将部分公共收益用于弥补物业费不足，且这一约定得到了业主大会的认可。
- 若合同约定违法：如果合同约定违反了法律法规的强制性规定，或者损害了业主的合法权益，那么这种约定就是违法的。例如，业委会未经业主大会同意，擅自将公共收益全部或大部分给予物业公司，或者物业公司利用合同约定进行不正当利益输送等。
三、实际操作中的建议
审查合同内容：
- 在签订或审查此类合同时，应仔细审查合同内容，确保合同约定不违反法律法规的强制性规定，不损害业主的合法权益。
征求业主意见：
- 业委会在作出此类决定前，应充分征求业主的意见，确保决策过程公开透明，符合业主的意愿和利益。
监督合同执行：
- 在合同执行过程中，业委会和业主应加强对物业公司的监督，确保公共收益的使用符合合同约定和相关法律法规的规定。
四、可能的法律后果
合同无效：
- 如果合同约定违反了法律法规的强制性规定或损害了业主的合法权益，那么该合同约定可能被认定为无效。
法律责任：
- 如果物业公司或业委会违反了相关法律法规或合同约定，可能需要承担相应的法律责任，包括民事赔偿、行政处罚等。
总结与建议：业委会与物业公司合同约定公共收益归物业公司以弥补物业费不足，这一做法是否违法违规需结合具体情况判断。在实际操作中，应确保合同约定合法合规、尊重业主权益，并加强监督和执行。如果您对此类问题存在疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。