在项目经理责任承包制中，项目部员工缴纳风险抵押金的合法性需分情况讨论：

1. 若风险抵押金制度有明确合同依据且符合法律规定：

   • 如果项目经理与项目部员工之间签订了明确的责任承包合同，且合同中明确规定了风险抵押金的缴纳、管理、退还等条款，同时这些条款不违反《中华人民共和国劳动合同法》及其他相关法律法规的强制性规定（如不得以押金、保证金等名义变相收取费用，不得侵犯员工合法权益等），那么这种缴纳行为在合同框架内是合法的。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第九条，用人单位招用劳动者，不得扣押劳动者的居民身份证和其他证件，不得要求劳动者提供担保或者以其他名义向劳动者收取财物。但此条款主要限制的是用人单位直接向劳动者收取财物的行为，若风险抵押金是通过合法合同形式，且作为双方共同承担项目风险的一种方式，可能不直接受此条款限制。然而，仍需确保合同内容合法、公平，不损害员工利益。

2. 若风险抵押金制度缺乏合同依据或违反法律规定：

   • 如果项目经理或公司单方面要求项目部员工缴纳风险抵押金，且没有签订相关合同或合同条款违法（如强制缴纳、不退还、用于非项目风险目的等），那么这种行为是违法的。员工有权拒绝缴纳，并可以向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
   • 法律后果：根据《中华人民共和国劳动合同法》第八十四条，用人单位违反本法规定，以担保或者其他名义向劳动者收取财物的，由劳动行政部门责令限期退还劳动者本人，并以每人五百元以上二千元以下的标准处以罚款；给劳动者造成损害的，应当承担赔偿责任。

3. 特殊情况下的合法性考量：

   • 在某些特定行业或项目中，如建筑、工程等领域，为了确保项目的顺利进行和风险的共同承担，可能会存在风险抵押金或类似性质的保证金制度。但即便如此，也必须确保该制度的合法性、合理性和透明度，且不得违反相关法律法规的强制性规定。
   • 建议：在实施风险抵押金制度前，建议咨询专业律师或法律机构，确保制度设计的合法性和合规性，避免潜在的法律风险。

总结与建议：

• 项目经理责任承包制中，项目部员工缴纳风险抵押金的合法性取决于合同条款的合法性和合理性。
• 在签订相关合同时，务必确保合同内容合法、公平，不损害员工利益，并明确风险抵押金的缴纳、管理、退还等条款。
• 如遇违法收取风险抵押金的情况，员工有权拒绝缴纳，并可以向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
• 如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将竭诚为您提供专业的法律服务。