关于店面拆迁时办理证件是否需要交费及合法性的问题，结论如下：
是否需要交费：
- 一般情况：在店面拆迁过程中，办理与拆迁相关的证件（如拆迁补偿协议、产权调换证明等）通常不应额外收取费用。这些证件的办理是拆迁程序的一部分，相关费用一般已包含在拆迁补偿或安置费用中。
- 特殊情况：如果拆迁过程中涉及需要办理新的营业执照、税务登记证等经营性证件，且这些证件的办理与拆迁无直接关联，而是由于店面搬迁后需要在新地点重新注册或变更，那么根据相关规定，可能需要缴纳一定的工本费或税费。但这种情况下的费用并非拆迁证件办理费用，而是正常经营活动的行政费用。
合法性分析：
- 拆迁证件办理费用：根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》等相关法律法规，拆迁过程中应确保被拆迁人的合法权益，包括办理相关证件的便利性和费用合理性。任何以拆迁证件办理为名收取的额外费用，均可能涉嫌违法。
- 经营性证件办理费用：对于因店面搬迁而需要办理的新经营性证件，其费用收取应遵循相关行政法规的规定。只要费用收取符合法定标准和程序，即视为合法。
建议与行动：
- 核实费用性质：如果拆迁方或相关部门要求缴纳费用，应首先核实费用的性质和用途。确认是否为拆迁证件办理费用，还是其他经营性证件的办理费用。
- 要求出具依据：对于任何要求缴纳的费用，均有权要求拆迁方或相关部门出具收费依据和标准。如果无法提供合法依据，有权拒绝缴纳。
- 寻求法律援助：如果认为拆迁方或相关部门的收费行为违法或不合理，可以向当地拆迁管理部门投诉，或寻求专业律师的法律援助，以维护自身合法权益。
总结：店面拆迁时办理与拆迁直接相关的证件通常不应额外收取费用。如果涉及需要办理新的经营性证件，可能需要根据相关规定缴纳一定的工本费或税费。对于任何要求缴纳的费用，应核实其性质和用途，并要求出具合法依据。如有疑问或争议，建议及时咨询专业律师以获取法律帮助。