结论前置：违章作业并不影响工伤的认定。只要员工在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害，且不存在特定排除情形（如故意犯罪、醉酒或吸毒、自残或自杀等），就应当被认定为工伤。

一、工伤认定的基本原则与条件

工伤认定遵循的是无过错责任原则，即不考虑员工在事故中是否存在过错，而主要关注伤害与工作之间的因果关系。根据《工伤保险条例》的相关规定，工伤认定的核心条件主要包括以下几点：

1. 时间地点条件：职工必须在工作时间和工作场所内；
2. 因果关系条件：职工必须因工作原因受到事故伤害；
3. 排除条件：职工受伤不是由于故意犯罪、醉酒或者吸毒、自残或者自杀这些特定情形导致的。

具体来说，《工伤保险条例》第十四条明确规定了应当认定为工伤的七种情形，其中第一种就是“在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害的”。这一规定体现了工伤保险的无过错责任原则，即使员工在工作中存在违章作业等过错行为，只要满足上述条件，依然可以认定为工伤。

二、违章作业与工伤认定的关系

违章作业，即职工在工作中违反了操作流程或相关规章制度的行为，并不是工伤认定的排除条件。从法律条文来看，是否遵守操作规程或规章制度，并不是工伤认定的必要条件。例如，如果工人在操作机器时违反了操作规程，但这一行为是在工作时间和工作场所内，且是因工作原因导致的伤害，那么该工人依然应当被认定为工伤。

三、不能认定为工伤的特殊情形

尽管工伤认定遵循无过错原则，但也存在一些明确不能认定为工伤的情形。根据《工伤保险条例》第十六条的规定，以下三种情形不得认定为工伤或者视同工伤：

1. 故意犯罪：如果员工在实施犯罪行为过程中受伤，如抢劫时受伤，这种伤害与工作无关，且违反了法律法规，因此不能认定为工伤。
2. 醉酒或者吸毒：员工在工作时处于醉酒状态或吸食、注射毒品导致的伤亡，也不能认定为工伤。这是因为酒精和毒品会对人的神经系统产生影响，导致行为失控和判断力下降。在这种状态下发生的事故与工作本身的关联性被弱化，且违反了法律法规和社会公德。
3. 自残或者自杀：员工故意伤害自己或自杀的行为，显然与工作无关，是员工自主选择的行为，并非因工作原因导致。因此，这种情形也不能被认定为工伤。

四、实际操作建议

在实际操作中，工伤认定往往需要结合具体情况进行综合判断。如果遇到了类似问题，建议尽快收集并保留好相关证据，如医疗记录、事故报告、目击者证言等，以便在需要时提供有力的支持。同时，也可以及时向我咨询，以便更准确地了解自己的权益和相关的法律程序。

总结：违章作业并不影响工伤的认定，关键在于是否满足工伤认定的法定条件。如果遭遇工伤事故，不要因为自己的违章行为而放弃申请工伤认定的权利，应及时咨询并了解自己的权益。