在二审中提出诉讼时效抗辩权，法院的处理方式需分情况讨论，具体如下：

1. 若一审中未提出诉讼时效抗辩，二审中原则上不得提出
   根据《最高人民法院关于审理民事案件适用诉讼时效制度若干问题的规定》第三条，当事人在一审期间未提出诉讼时效抗辩，在二审期间提出的，人民法院原则上不予支持，除非基于新的证据能够证明对方当事人的请求权已过诉讼时效期间。

   • 例外情形：若二审中提出的新证据（如对方自认、书面文件等）能直接证明诉讼时效已届满，法院可能采纳抗辩。
     
   • 实务提示：诉讼时效抗辩需在一审阶段主动提出，否则可能丧失权利。

2. 若一审中已提出诉讼时效抗辩但被驳回，二审可继续主张
   若一审中当事人已提出时效抗辩，但法院未采纳（如认为时效中断、中止等），二审中可针对一审认定事实或法律适用错误继续抗辩。

   • 审查重点：二审法院会审查一审是否遗漏关键事实（如对方是否在时效期间内主张权利）、是否错误适用时效中断/中止规则等。
     
   • 案例参考：若一审未认定债务人已部分还款导致时效中断，二审中若能提供还款凭证，可能推翻一审判决。

3. 若一审中未提出但二审因新证据需提出，需严格举证
   若二审中因新发现的证据（如对方书面承认债权超过时效）需提出抗辩，需满足：

   • 证据真实性：需为原始证据或经公证的复印件；
     
   • 证据关联性：需直接证明对方请求权已过时效（如催款记录显示最后一次主张权利的时间）；
     
   • 程序合法性：需在二审法庭辩论终结前提交，并说明一审未提交的合理理由（如证据刚取得、对方隐瞒等）。

实务建议：

• 时效抗辩需“主动+及时”：一审阶段务必明确提出，并围绕时效起算、中断、中止等要点举证；
  
• 二审翻案难度较高：若无新证据或一审未严重违反程序，二审采纳时效抗辩的可能性较低；
  
• 特殊情形注意：对支付存款、债券等本息请求权，诉讼时效不适用（如银行存款纠纷）。
  

如有具体案件细节（如一审判决内容、新证据类型等），可进一步向我咨询，我会结合案情分析抗辩策略。