退休三年后在连锁药店任驻店药师每月领取1000元工资，这一行为本身并不直接构成违法。不过，我们可以从多个角度来详细分析这个问题：

1. 退休人员再就业的法律性质：

   • 退休人员再就业，通常被视为劳务关系而非劳动关系。这是因为退休人员已经享受了养老保险待遇，不再属于劳动法的调整范围。因此，他们与用人单位之间建立的是劳务合同关系，而非劳动合同关系。
   • 在劳务关系中，双方的权利和义务主要由劳务合同来约定，包括工作内容、工作时间、报酬等。只要双方协商一致，且不违反法律法规的强制性规定，就是合法的。

2. 工资支付的合法性：

   • 对于退休人员再就业的工资支付，没有特定的法律限制。只要用人单位按照劳务合同的约定，按时足额支付工资，就是合法的。
   • 在您的情况下，如果连锁药店与您签订了劳务合同，并明确约定了每月支付1000元工资，且药店按照约定支付了工资，那么这一行为就是合法的。

3. 可能存在的法律风险：

   • 虽然退休人员再就业本身不违法，但如果用人单位在招聘、使用退休人员过程中存在歧视、欺诈等违法行为，或者未按照劳务合同的约定支付工资、提供劳动条件等，就可能构成违法。
   • 另外，如果退休人员在工作过程中因工作原因受到伤害，由于不属于劳动关系，可能无法享受工伤保险待遇。但根据《最高人民法院关于审理劳动争议案件适用法律问题的解释（一）》第三十二条，如果用人单位与其招用的已经依法享受养老保险待遇或者领取退休金的人员发生用工争议而提起诉讼的，人民法院应当按劳务关系处理，此时可以根据双方过错承担相应责任。

4. 建议：

   • 如果您作为退休人员再就业，建议与用人单位签订详细的劳务合同，明确双方的权利和义务，包括工作内容、工作时间、报酬、劳动保护等。
   • 在工作过程中，注意保留相关证据，如工作记录、工资支付凭证等，以备不时之需。
   • 如果发生纠纷或争议，可以及时咨询专业律师，了解自己的权益和维权途径。

综上所述，退休三年后在连锁药店任驻店药师每月领取1000元工资，这一行为本身并不违法。但为了确保自己的权益得到保障，建议您与用人单位签订详细的劳务合同，并注意保留相关证据。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。