招标代理公司单独收取评审费是否合法，需分情况讨论：

1. 若招标文件或合同中有明确约定：

   • 合法性分析：根据《中华人民共和国招标投标法》及相关规定，招标代理公司的收费项目和标准通常应在招标文件中明确，或者在与招标人签订的合同中约定。如果招标文件或合同中明确规定了评审费作为招标代理服务的一部分，并由招标代理公司单独收取，那么这种行为是合法的。
   • 建议：招标人在签订招标文件或合同时，应仔细审查相关条款，确保对评审费的收取有明确的约定，并了解其具体用途和计算方式。

2. 若招标文件或合同中无明确约定：

   • 合法性分析：如果招标文件或合同中没有明确约定评审费的收取，那么招标代理公司单独收取评审费可能缺乏合法依据。在这种情况下，招标人有权拒绝支付，并可以要求招标代理公司按照合同或法律规定提供服务。
   • 潜在风险：若招标代理公司坚持收取评审费，可能引发合同纠纷。招标人可以通过法律途径维护自己的权益，如向相关部门投诉或提起诉讼。

3. 评审费的合理性与透明度：

   • 合理性：即使招标文件或合同中约定了评审费，其金额也应合理，不得过高或存在不合理的收费项目。评审费的收取应与招标代理公司提供的服务内容、工作量等相匹配。
   • 透明度：招标代理公司应向招标人明确说明评审费的计算方式、用途等，确保收费的透明度。这有助于增强招标人对招标代理公司的信任，减少纠纷的发生。

4. 相关法律法规的遵循：

   • 招标投标法：招标代理公司在收取评审费时，必须严格遵守《中华人民共和国招标投标法》及相关规定，不得违反法律法规的强制性规定。
   • 价格法：评审费的收取也应符合《中华人民共和国价格法》的规定，不得存在价格欺诈、哄抬价格等违法行为。

总结与建议：

• 招标人在与招标代理公司合作时，应确保招标文件或合同中明确约定评审费的收取事项，包括金额、计算方式、用途等。
• 招标代理公司应遵守相关法律法规，合理、透明地收取评审费，并提供优质的服务。
• 若发生纠纷，双方应首先通过协商解决；协商不成的，可以寻求法律途径解决。

如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律解答。