针对您提出的问题“车祸对方次责医疗总费1000是保险公司全额赔付吗”，以下是我的详细解答：
首先，需要明确的是，在车祸中，如果对方被认定为次要责任，那么对方并不需要承担您的全部医疗费用，而是根据责任比例来分担。对于您提到的医疗总费用1000元，具体赔偿情况会受到多个因素的影响。
一、保险赔偿机制
交强险：
- 交强险是强制购买的保险，其医疗费用赔偿限额在有责情况下为18,000元。但在这个案例中，由于医疗总费用只有1000元，远低于交强险的赔偿限额，所以交强险会在此限额内进行赔付，但具体赔付比例还需根据责任划分来确定。
商业三者险：
- 如果对方购买了商业三者险，那么超出交强险赔偿限额的部分（虽然在这个案例中不太可能超出），或者根据责任划分后对方应承担的部分，可以由商业三者险来赔付。但同样，具体赔付金额和比例需根据保险合同的约定来确定。
二、责任划分与赔偿比例
- 在车祸中，如果对方被认定为次要责任，那么对方通常需要承担一定比例的医疗费用。这个比例可能因地区、具体事故情况以及保险条款的不同而有所差异。一般来说，次要责任可能意味着对方需要承担30%或更少的医疗费用，但具体比例需由交警部门或法院根据事故情况来确定。
三、特殊情况考虑
非医保用药：
- 保险合同中可能规定只赔偿医保范围内的用药费用。如果您的医疗费用中包含了非医保用药，那么这部分费用可能无法由保险公司全额赔付，需要由对方个人承担一部分或全部。
医疗合理性：
- 保险公司会对医疗费用的合理性进行审核。如果存在过度医疗或不必要的检查、治疗等情况，保险公司可能会拒绝赔付这部分费用。
四、建议与总结
- 鉴于上述情况，我建议您首先与对方及对方的保险公司进行沟通，了解具体的赔偿流程和比例。同时，妥善保存所有与治疗相关的票据和证据，以便在需要时提供证明。
- 如果沟通无果或赔偿比例无法达成一致，您可以考虑向地方人民调解委员会、公安机关交通管理部门申请调解，或者直接向人民法院提起诉讼以维护自己的合法权益。
综上所述，车祸对方次责时，医疗总费用1000元并不一定由保险公司全额赔付。具体赔付金额和比例需根据责任划分、保险条款以及医疗费用的合理性等多个因素来确定。希望这些解答能对您有所帮助。