结论：员工因过敏辞职，用人单位扣钱是否合法，需根据具体情况判断，一般而言，若过敏不属于工伤且员工未违反公司规定或劳动合同约定，用人单位扣钱是不合法的。

分析说明：

1. 过敏是否构成工伤：

   • 根据《工伤保险条例》的规定，工伤通常指的是在工作过程中因工作原因受到的伤害或患职业病。过敏是否构成工伤，需看过敏是否与工作有直接关系，例如是否因接触工作环境中特定的过敏原而导致。若过敏并非因工作原因引起，则一般不构成工伤。
   • 若过敏构成工伤：员工应享受工伤保险待遇，包括医疗费用报销、停工留薪期间的工资福利等。此时，员工因过敏辞职，用人单位不应扣钱，且应依法支付相关工伤保险待遇。
   • 若过敏不构成工伤：则进入下一环节的分析。

2. 员工辞职原因及公司规定：

   • 员工因个人健康原因（如过敏）辞职，属于个人原因辞职。根据《劳动合同法》的规定，员工提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。在试用期内，员工提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。
   • 若员工未违反公司规定或劳动合同约定：用人单位无权扣钱。员工辞职是其合法权利，用人单位应依法办理离职手续，并结清工资等费用。
   • 若员工违反公司规定或劳动合同约定：如未提前通知、未办理离职手续等，用人单位可能根据内部规定或劳动合同约定扣除部分费用，但扣除的费用应合理且符合法律法规的规定。不过，这种扣除通常与过敏本身无直接关系，而是与员工的辞职行为有关。

3. 用人单位扣钱的合法性：

   • 用人单位扣钱必须基于合法、合理的理由，且需符合法律法规的规定。若员工因过敏辞职，且未违反公司规定或劳动合同约定，用人单位扣钱则缺乏合法依据。
   • 若用人单位扣钱：员工有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。

行动建议：

• 对于员工：若因过敏辞职被扣钱，首先应查看自己的劳动合同和公司规定，了解扣钱的具体原因和依据。若认为扣钱不合法，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
• 对于用人单位：应依法办理员工离职手续，结清工资等费用。若员工存在违反公司规定或劳动合同约定的行为，可以依法扣除部分费用，但应确保扣除的费用合理且符合法律法规的规定。

后续思考：

• 员工在入职前应了解自己的健康状况是否适合从事该工作，以及工作环境中是否存在可能引发过敏的物质。
• 用人单位应建立健全的劳动规章制度，明确员工辞职、离职等相关规定，以避免不必要的纠纷。

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