当实际经营者与登记经营者不一致，且实际经营者遭受营业损失时，其权利主张需根据具体情况和相关法律规定来确定，以下从不同角度进行分析：
一、合同责任角度
一般原则：
- 无论是以登记经营者的名义还是实际经营者的名义对外签订合同，只要合同履行出现问题，相对方（如供应商、客户等）都有权向登记经营者和实际经营者主张权利。二者通常需对合同违约行为承担连带责任。
实际经营者的权利主张：
- 若营业损失是由于合同相对方违约造成的，实际经营者可以联合登记经营者（若其愿意）共同向违约方主张赔偿。
- 若登记经营者不愿参与，实际经营者也可先以登记经营者的名义（需有合法授权或事后追认）或自己的名义（若合同中有明确约定或相对方明知实际经营者身份）向违约方主张权利。
案例说明：
- 假设甲是登记经营者，乙是实际经营者，乙以该经营主体的名义与丙签订货物买卖合同。后因丙违约导致乙遭受营业损失，乙可以要求甲和丙共同承担赔偿责任，或单独要求丙承担赔偿责任（若甲不愿参与或乙有合法授权）。
二、侵权责任角度
一般原则：
- 在侵权情况下，如因产品缺陷、服务不当等导致实际经营者遭受损失，侵权方应承担主要责任。
- 若登记经营者对侵权行为有过错（如明知或应知而未采取必要措施），则也可能需要承担相应的侵权责任。
实际经营者的权利主张：
- 实际经营者可以直接向侵权方主张损害赔偿。
- 若登记经营者也有过错，实际经营者还可以要求登记经营者承担相应的赔偿责任。
案例说明：
- 在一家登记经营者为A，实际经营者为B的餐厅中，若因工作人员操作不当导致餐厅设施损坏或顾客受伤进而影响餐厅营业，B可以直接向侵权方（如工作人员或保险公司）主张损害赔偿。若A对餐厅管理存在疏忽，B还可以要求A承担相应的赔偿责任。
三、内部追偿与风险防范
内部追偿：
- 在登记经营者和实际经营者对外承担连带责任后，二者之间可以根据双方的约定或者过错程度进行内部追偿。
- 如有书面协议明确责任分担，按协议执行；如无约定，则根据各自过错大小确定追偿份额。
风险防范：
- 为避免法律风险，建议企业在经营过程中确保实际经营者与登记经营者的一致性。
- 若存在不一致情况，应及时进行变更登记或采取其他合法措施明确责任和义务。
- 对于重要事务的决策和执行，应确保有明确的授权和委托关系，并保留相关证据。
四、特殊情境下的刑事责任（虽不直接涉及营业损失主张，但为全面分析提供背景）
- 在某些严重违法情况下，如诈骗、非法集资等，实际经营者可能面临刑事责任的追究。
- 若登记经营者明知或应知实际经营者的犯罪行为而为其提供便利或帮助，也可能被认定为共犯或承担其他相应的刑事责任。
- 注意：此部分虽不直接涉及营业损失的主张，但提醒实际经营者在经营过程中应遵守法律法规，避免涉及刑事犯罪。
总结与建议：
- 实际经营者在遭受营业损失时，应首先分析损失原因，确定是合同违约、侵权行为还是其他原因造成的。
- 根据损失原因，选择合适的法律途径主张权利，如提起民事诉讼、申请仲裁等。
- 在主张权利过程中，注意收集并保留相关证据，如合同、发票、聊天记录、监控录像等。
- 若涉及复杂法律问题或金额较大，建议及时咨询专业律师（即我，孙万超律师，专注于民间借贷、股权转让、公司事务领域），以确保自身权益得到充分保障。