在民事立案过程中，如果发现两个法院对同一案件都有管辖权，或者因各种原因导致案件被两个法院立案，可以按照以下方式处理：

1. 协商管辖：

   • 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，两个以上人民法院都有管辖权的诉讼，原告可以向其中一个人民法院起诉。如果原告向两个以上有管辖权的人民法院起诉的，由最先立案的人民法院管辖。
   • 在实践中，如果两个法院都认为自己对案件有管辖权，它们可能会进行协商，以确定哪个法院更适合审理该案件。这种协商通常基于案件的性质、当事人的住所地、合同履行地等因素。

2. 指定管辖：

   • 如果两个法院对管辖权有争议，且协商不成，那么它们可能会报请它们的共同上级人民法院来指定管辖。
   • 上级人民法院在指定管辖时，会综合考虑案件的具体情况、当事人的利益以及司法效率等因素，以确保案件能够得到公正、高效的审理。

3. 移送管辖：

   • 如果一个法院在立案后发现它对案件没有管辖权，那么它应该将案件移送给有管辖权的人民法院。
   • 移送管辖通常发生在案件受理初期，当法院对案件的管辖权产生疑问或发现错误时。

4. 当事人选择（在特定情况下）：

   • 在某些特定类型的案件中，如合同纠纷，当事人可能会在合同中约定争议解决的方式和地点，包括选择特定的法院进行诉讼。
   • 如果合同中有这样的约定，并且该约定不违反法律的强制性规定，那么当事人应该按照合同的约定向约定的法院提起诉讼。

处理建议：

• 如果您发现自己的案件被两个法院立案，或者对哪个法院有管辖权存在疑问，建议您首先与两个法院进行沟通，了解它们对案件管辖权的看法和依据。
• 如果沟通无果，您可以考虑向两个法院的共同上级人民法院申请指定管辖，或者根据案件的具体情况选择向其中一个更有管辖权的法院提起诉讼。
• 在整个过程中，保留好所有与案件相关的文件和证据，以便在需要时提供给法院。

如果您在处理此类问题时遇到任何困难或疑问，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。