针对您提出的“公司说旷工一天扣三天工资怎么办”的问题，这确实是一个涉及劳动者权益的重要事项。以下是我为您提供的详细分析和建议：

一、了解法律规定

首先，您需要明确的是，根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，用人单位不得克扣或无故拖欠劳动者的工资。同时，《工资支付暂行规定》第十六条也明确指出，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。

二、判断扣款合法性

1. 非法扣款情形：如果您的劳动合同或公司规章制度中未明确旷工扣款的具体规则，或者扣款比例超过了法定上限（如日薪的三倍），那么这种扣款行为就是违法的。

2. 合法扣款前提：即使公司规章制度中有旷工扣款的规定，也需要满足三个条件：一是制度必须经过民主程序制定并公示；二是扣款比例必须合理，不超过月薪的20%；三是扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。

三、核查公司规章制度与合同

1. 制度有效性审查：您需要确认公司的规章制度是否经过民主程序制定，并且已经向您公示。如果未经您签字确认或未公示，那么这些制度条款是无效的。

2. 争议条款分析：如果公司制度中确实规定了“旷工一天扣三天工资”，您需要结合行业特性、岗位性质以及实际损失来评估这一规定的合理性。例如，对于生产连续性要求高的岗位，公司可能会适当提高扣款比例，但仍然需要符合法律上限。

四、与公司协商沟通

1. 主动沟通策略：您可以以书面形式向公司提出异议，引用具体法律条款来说明扣款的违法性。同时，要求公司提供扣款依据，包括经济损失证明、制度公示记录等。

2. 协商解决方案：在沟通过程中，您可以建议公司按照实际缺勤天数来扣款，或者通过补班、绩效扣分等方式来替代罚款。如果涉及重大误解或显失公平，您还可以主张撤销扣款决定。

五、寻求外部帮助

1. 劳动监察投诉：如果与公司协商无果，您可以向当地人力资源和社会保障局劳动监察部门提交书面投诉材料，附上相关证据清单（如工资条、考勤记录、制度文件等）。

2. 申请劳动仲裁：您还可以准备仲裁申请书、身份证明、劳动关系证明以及扣款凭证等材料，向劳动仲裁机构申请仲裁。如果因此解除劳动合同，您还可以主张返还违法扣款并支付经济补偿金。

3. 法律诉讼途径：如果您对仲裁结果不服，可以在15日内向法院提起诉讼。在诉讼过程中，您需要提供新证据来支持您的诉求。

六、保留关键证据

在处理此类纠纷时，保留关键证据至关重要。您需要保存劳动合同、工资单、考勤记录等原件，并收集制度培训签到表、电子邮件通知等公示证明。同时，记录协商过程（如录音需征得对方同意）也是很有帮助的。

七、后续预防措施

为了避免类似纠纷再次发生，您可以在签订劳动合同时仔细审阅扣款相关条款，拒绝签署空白合同。同时，定期查阅公司公告栏或内部系统，及时获取制度修订信息。此外，参加劳动法规培训、关注典型案例也是提升自我保护能力的好方法。

总之，面对公司“旷工一天扣三天工资”的规定，您需要保持冷静、了解法律、核查制度、积极沟通，并在必要时寻求外部帮助。希望这些建议能对您有所帮助。