用人单位扣除员工全部的绩效是否合理，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下是从不同角度进行的分析：
合法且合理的情况
合同与制度明确约定：
- 如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了绩效工资的发放条件、考核标准及扣除情形，且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位在符合约定条件时，可以扣除部分或全部绩效工资。
- 举例：合同中约定“若员工年度绩效考核不合格，则扣除全年绩效工资”，若员工确实未达到考核标准，用人单位有权按此执行。
员工存在严重失职或违规行为：
- 若因员工个人原因（如严重失职、营私舞弊）导致公司损失，且公司有明确制度支持扣除绩效工资，则扣除行为可能具有合理性。
- 举例：员工因疏忽导致公司重大经济损失，公司根据规章制度扣除其全部绩效工资作为赔偿。
绩效考核过程公正透明：
- 绩效考核标准应清晰、客观，避免主观随意性。考核过程应严格按照既定制度和流程进行，确保公平、公正。同时，公司应及时向员工反馈考核结果，并给予申诉机会。
- 举例：公司设定了明确的销售业绩考核标准，员工未达到标准，且考核过程公正透明，公司扣除其绩效工资是合理的。
不合法或不合理的情况
规章制度不合法或缺失：
- 若公司未制定合法的绩效管理制度，或制度内容违反法律法规（如扣减幅度过大、缺乏明确标准等），则扣除行为不合理。
- 举例：公司未就绩效管理制度与员工进行有效沟通或征求意见，导致制度不合法，此时扣除员工全部绩效工资是不合理的。
绩效考核不公正：
- 考核标准模糊、主观性强，或存在偏袒、歧视等行为，均会损害考核的公正性。未按既定流程和标准进行考核，或未给予员工充分的申诉机会，也构成不合理扣减。
- 举例：公司考核标准不明确，且考核过程中存在主观偏袒，导致员工绩效被不合理扣除。
未履行告知义务：
- 公司在扣减绩效工资前未向员工明确告知考核标准、结果及扣减原因，违反了员工的知情权。缺乏有效的沟通机制，使员工无法及时了解自己的工作表现与绩效奖扣减之间的关联。
- 举例：公司未提前告知员工绩效考核标准，考核后直接扣除其全部绩效工资，未给予任何解释和沟通机会。
员工权益保障与建议
- 沟通协商：员工认为扣减不合理时，首先应与公司进行沟通协商，要求说明扣减依据和理由。
- 法律途径：若协商无果，员工可向劳动监察部门投诉，或申请劳动仲裁以维护自己的合法权益。在申请仲裁时，员工需要提供相关证据，如劳动合同、公司规章制度、绩效考核结果等，以证明自己的主张。
- 关注制度建设：建议公司完善绩效管理制度，确保其合法性、公正性与透明度，以减少潜在的纠纷和风险。同时，员工也应积极了解公司规章制度，明确自己的权益和义务。
总结来说，用人单位扣除员工全部的绩效是否合理，取决于合同与制度的约定、绩效考核的公正性以及是否履行了告知义务等多个因素。员工在面对不合理扣减时，应依法维护自己的权益；而公司也应积极完善相关制度，构建和谐的劳动关系。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。