用人单位以业绩考核扣除员工工资是否合理，需分情况讨论：
一、合理的情况
劳动合同有明确约定：
- 如果劳动合同或公司的规章制度中，事先明确约定了业绩考核标准及未达到标准时的工资扣减方式，并且这些约定不违反法律法规的强制性规定，那么公司按照约定扣减工资是合法的。例如，某销售公司与员工在劳动合同中明确规定，销售人员每月需达到一定的销售业绩，若未达标，则工资将按一定比例扣减，但扣减后的工资不得低于当地最低工资标准。
规章制度合法且经过民主程序：
- 公司的绩效考核制度如果经过民主程序制定（如职工代表大会讨论通过），并已向员工公示或告知，同时该制度内容合理，能够客观、公正地反映员工的工作表现和业绩情况，那么依据该制度扣减业绩不佳的员工工资也是合法的。
二、不合理的情况
无约定或约定不明：
- 如果劳动合同中没有关于业绩考核和工资扣减的条款，或者约定不明确，公司在员工业绩不佳时擅自扣减工资是违法的。例如，某公司员工的劳动合同中并未提及业绩考核和工资扣减的相关内容，公司却因员工某月业绩不佳而扣减其工资，这种行为是不合法的。
扣减后工资低于最低工资标准：
- 根据法律规定，用人单位支付劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。即使员工业绩不佳，公司扣减工资后也不能使员工的实际工资低于这一标准，否则即为违法。例如，某地最低工资标准为每月2000元，某员工月工资为3000元，若因其业绩不佳而被扣除1200元，导致实际工资低于最低工资标准，这种扣减行为是不合法的。
规章制度不合理或未经民主程序：
- 如果公司的绩效考核制度存在不合理的内容，或者该制度没有经过民主程序制定和公示，那么依据这样的制度扣减员工工资是不合法的。例如，某公司的绩效考核完全由上级领导主观评定，没有客观的考核指标和评分标准，这种情况下扣减员工工资是不合理的。
三、员工的权益保护
面对不合理的工资扣减，员工可以采取以下措施维护自身合法权益：
- 与用人单位协商：首先尝试与公司的人力资源部门或负责人进行沟通，协商解决争议。
- 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，可以向当地的劳动监察部门投诉，请求介入调查并处理。
- 申请劳动仲裁：若问题仍未得到解决，员工可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，通过法律途径解决争议。
总结与建议：
用人单位以业绩考核扣除员工工资是否合理，需综合考虑劳动合同的具体约定、用人单位规章制度的合法性及公示情况、以及扣减后工资是否低于最低工资标准等多个因素。作为员工，在面临此类问题时，应了解自己的权益并采取适当的措施进行维权。如果仍有疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议。