结论：若法院将行政机构内部的文件作为法律依据，这通常违背了《中华人民共和国行政诉讼法》中关于审理行政案件法律适用范围的相关规定。具体来说，行政机构内部文件一般不属于法院审理行政案件时可以直接依据的法律文件范畴。

详细分析：

1. 法律适用范围：

   • 根据《中华人民共和国行政诉讼法》及相关司法解释，人民法院在审理行政案件时，主要依据的是法律、行政法规、地方性法规、自治条例和单行条例。这些法律文件具有公开性、普遍适用性和权威性，是法院审理案件的基本依据。
   • 行政机构内部文件，如内部通知、指导意见等，通常不具备上述法律文件的特征，它们更多是行政机构内部管理和运作的参考，而非对外具有普遍约束力的法律规范。

2. 规章的参照适用：

   • 除了上述法律文件外，人民法院在审理行政案件时，还可以参照规章（包括部门规章和地方政府规章）。但“参照”并不意味着规章可以直接作为法律依据，而是法院在审理案件时，会根据案件具体情况对规章进行审查判断，符合法律、行政法规规定的规章可以适用，与法律、行政法规相抵触的规章则不予适用。
   • 行政机构内部文件显然不属于规章的范畴，因此不能作为法院审理案件的直接依据。

3. 法律后果：

   • 如果法院错误地将行政机构内部文件作为法律依据，可能会导致判决结果的不公正或违法。因为内部文件可能缺乏公开性、透明度和普遍适用性，其内容和解释可能因行政机构的不同而有所差异，从而损害当事人的合法权益。
   • 在这种情况下，当事人可以通过上诉或申请再审等法律途径来维护自己的权益，要求法院重新审理案件并依据正确的法律文件作出判决。

建议：

• 对于当事人来说，如果发现法院在审理案件时错误地引用了行政机构内部文件作为法律依据，应及时向法院提出异议，并要求法院依据正确的法律文件进行审理。
• 如果当事人对法院的判决结果有异议，可以通过上诉或申请再审等法律途径来维护自己的权益。
• 在日常生活中，当事人也应增强法律意识，了解并关注与自己权益相关的法律文件和规定，以便在必要时能够有效地维护自己的合法权益。

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