若母亲去世，其代持的儿子公司股份将作为遗产处理，具体处理方式需根据实际情况确定，可能涉及继承、股份过户及潜在纠纷解决等问题。以下是详细分析：

1. 股份的继承问题：

   • 母亲作为股份的代持人，其名下的股份在法律上属于母亲的个人财产（尽管实际权益可能归属于儿子）。因此，母亲去世后，这些股份将作为她的遗产进行继承。
   • 继承过程需遵循《中华人民共和国民法典》中关于继承的规定，包括遗嘱继承和法定继承。如果母亲留有遗嘱，且遗嘱中明确指定了股份的继承人，则按照遗嘱执行；如果没有遗嘱或遗嘱无效，则按照法定继承顺序，由母亲的配偶、子女、父母等第一顺序继承人继承。

2. 股份过户问题：

   • 在继承程序完成后，继承人需要办理股份过户手续，将股份从母亲名下过户到自己名下。这通常涉及与公司的沟通、提供相关继承文件（如死亡证明、继承权公证书等）以及遵守公司章程和股东名册的变更程序。
   • 如果儿子是股份的实际权益人，且其他继承人也认可这一事实，那么过户过程可能相对顺利。但如果存在争议或纠纷，可能需要通过法律途径解决。

3. 潜在纠纷的解决：

   • 在母亲去世后，如果其他继承人或相关方对股份的归属提出异议，可能引发继承纠纷。此时，需要依据相关法律法规和证据材料，通过协商、调解或诉讼等方式解决纠纷。
   • 作为实际权益人，儿子应保留好与母亲之间的代持协议、出资证明等相关证据材料，以便在纠纷发生时维护自己的合法权益。

4. 建议与措施：

   • 完善代持协议：在母亲健在时，建议儿子与母亲签订一份完善的股份代持协议，明确双方的权利义务、股份归属、过户条件等事项，以减少未来可能出现的纠纷。
   • 提前规划继承：母亲可以考虑提前立下遗嘱，明确指定股份的继承人，以避免法定继承可能带来的复杂性和不确定性。
   • 及时沟通协商：在母亲去世后，儿子应与其他继承人保持沟通协商，尽量通过友好方式解决股份过户和继承问题。
   • 寻求法律帮助：如果遇到复杂的法律问题或纠纷无法解决，儿子应及时寻求专业律师的帮助，以维护自己的合法权益。