事业单位在编人员犯罪后，若需追回其犯罪后领取的工资，可通过以下方式处理：

1. 内部纪律处分与工资扣减程序
   根据《事业单位工作人员处分暂行规定》第二十二条，事业单位在编人员被依法判处刑罚的，应给予降低岗位等级或撤职以上处分。若工资发放与岗位等级直接挂钩，单位可依据处分决定直接调整其工资标准，并追回多发放部分。例如，若员工被判处刑罚后仍按原岗位等级领取工资，单位可通过内部财务程序核减差额。
   操作要点：需确保处分决定已生效（如刑事判决生效），且工资调整与处分等级匹配，避免程序违法。

2. 民事诉讼追偿
   若单位已实际支付工资，且员工因犯罪行为导致劳动关系无效或被解除（如被开除），单位可依据《民法典》第一百二十二条（不当得利返还）或第九百八十五条（得利人没有法律根据取得不当利益的）提起民事诉讼，要求员工返还犯罪期间领取的工资。
   证据要求：需提供工资发放记录、刑事判决书、劳动关系解除证明等材料，证明工资支付缺乏合法依据。

3. 刑事附带民事诉讼或单独民事诉讼
   若员工犯罪行为直接造成单位经济损失（如贪污、挪用公款等），单位可在刑事诉讼中提起附带民事诉讼，或单独提起民事诉讼，要求返还工资及赔偿其他损失。
   适用情形：仅当工资与犯罪行为存在直接因果关系时（如员工利用职务便利领取工资后实施犯罪），方可主张返还。

4. 行政追缴程序（特定情形）
   若员工涉及贪污贿赂等职务犯罪，且工资属于违法所得，单位可配合纪检监察机关或司法机关，依据《刑法》第六十四条（犯罪物品的处理）申请追缴工资作为赃款赃物。
   限制条件：需以刑事判决认定工资为违法所得为前提，且追缴主体通常为司法机关，单位需通过协助执行程序参与。

操作建议：

• 优先启动内部程序：通过处分决定调整工资，效率较高且成本较低；
  
• 同步固定证据：保存工资发放记录、刑事判决书、劳动关系文件等，为后续诉讼或追缴提供依据；
  
• 区分工资性质：若工资属于合法劳动报酬（如基本工资），返还需以劳动关系解除或无效为前提；若属于违法所得（如贪污款项），可直接追缴。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程或证据准备要点。