综合工时制员工在休息日上班是否需要调休，需分情况讨论：
综合工时制的基本特点与休息日安排
- 综合工时制是一种因工作性质特殊或受自然条件限制，而采取以周、月、季、年等为周期综合计算工作时间的工时制度。这种制度允许企业根据实际情况灵活安排员工的工作时间和休息时间，但劳动者的基本休息和休假权利依然受到法律的严格保护。
- 根据《中华人民共和国劳动法》第三十八条，用人单位应当保证劳动者每周至少休息一日。这是法律对劳动者休息权益的基本保障，综合工时制也不例外。因此，虽然综合工时制没有固定的双休日安排，但劳动者每周至少应有一天的休息时间。
休息日上班的处理方式
- 若休息日上班未超出综合计算周期内的总工时：在这种情况下，员工在休息日上班可能被视为正常工作的一部分，用于平衡其他时间段内的工作时间。此时，企业可能不需要安排调休，但应确保在整个综合计算周期内，员工的工作时间不超过法定标准工作时间总数。
- 若休息日上班导致综合计算周期内总工时超出法定标准：在这种情况下，超出部分应被视为加班。根据《劳动法》的相关规定，休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。因此，企业可以选择支付加班费或者安排调休来补偿员工。
特殊情况下的处理
- 如果企业在休息日（非法定节假日）需要员工进行特定工作，且这部分工作时间超出了正常的法定工作时间，同时企业无法在整个综合计算周期内通过调整工作时间来平衡，那么这部分时间应被视为加班。企业应根据实际情况选择支付加班费或安排调休。
实际操作建议
- 企业角度：企业应制定合理的综合工时制方案，充分考虑劳动者的身心健康和工作生活平衡。在安排员工休息日上班时，应明确是否属于加班情况，并根据法律法规和内部规章制度进行相应补偿。
- 员工角度：员工应了解自己的工作时间和休息时间安排，以及加班补偿政策。如果认为自己的权益受到侵害，可以与企业沟通协商或向劳动部门投诉。
总结与建议：综合工时制员工在休息日上班是否需要调休，取决于具体的工作时间安排和是否超出法定标准工作时间总数。企业应遵守相关法律法规，确保劳动者的休息和休假权利得到保障。员工也应了解自己的权益和补偿政策，必要时可寻求法律帮助。如果你在这方面有任何疑问或困惑，可以直接向我咨询。