结论：公司不肯在员工自离时写“合同到期不续约”的原因可能涉及多个方面，包括但不限于公司管理策略、法律风险规避以及实际操作中的便利性等。以下是对这些原因的详细分析：
公司管理策略：
- 维护公司形象：公司可能认为，在员工自离的情况下，主动出具“合同到期不续约”的证明可能会给外界留下公司管理不善或员工流失严重的印象，从而影响公司的声誉和形象。
- 保持员工关系和谐：即使员工选择自离，公司也可能希望保持与员工的良好关系，以便在未来有合作机会或需要员工提供某些协助时能够顺利沟通。出具“合同到期不续约”的证明可能会被视为一种正式的“断绝关系”，不利于未来关系的维护。
法律风险规避：
- 避免潜在纠纷：员工自离可能涉及多种原因，包括但不限于个人职业规划、家庭因素、对公司的不满等。如果公司轻易出具“合同到期不续约”的证明，可能会被员工或第三方误解为公司在合同到期前就已知晓或同意员工离职，从而引发不必要的法律纠纷。
- 保护公司利益：在某些情况下，员工自离可能给公司带来一定的损失，如未完成的工作任务、泄露的商业秘密等。公司可能希望通过不出具此类证明的方式，保留在必要时追究员工责任的权利。
实际操作中的便利性：
- 简化流程：对于公司而言，处理员工离职通常涉及一系列繁琐的流程，包括办理离职手续、结算工资、转移社保等。出具“合同到期不续约”的证明可能并不是这些流程中的必要环节，因此公司可能选择省略这一步骤以简化流程。
- 减少工作量：出具证明需要公司投入一定的人力和时间进行审核和制作。如果员工自离的情况较为普遍，公司可能会认为出具此类证明会增加不必要的工作量，从而选择不出具。
法律建议：
- 对于员工而言，如果希望获得“合同到期不续约”的证明，可以与公司进行沟通协商，明确表达自己的需求和理由。如果公司拒绝出具，员工可以了解相关法律法规，评估自己是否有权要求公司出具此类证明，并考虑通过法律途径维护自己的权益。
- 对于公司而言，在处理员工离职时，应遵循相关法律法规和公司内部规章制度，确保流程的合法性和合规性。如果员工提出出具“合同到期不续约”的证明的要求，公司应根据实际情况进行评估和决策，并在必要时咨询专业律师的意见。
可能后果：
- 如果员工因公司拒绝出具证明而提起劳动仲裁或诉讼，公司可能需要承担举证责任，证明自己拒绝出具证明的合理性和合法性。如果公司无法提供充分证据支持自己的主张，可能会面临不利的法律后果。
- 另一方面，如果员工滥用此类证明进行不正当行为（如虚构离职原因以获取其他利益），公司也有权追究员工的法律责任。
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