结论：动物运输车辆有检疫证但没有回收，这一行为是否合法，需结合具体情况及相关法律法规进行综合判断。以下从多个角度进行分析：

1. 检疫证的性质与要求：

   • 检疫证是动物及其产品运输过程中的重要法律文件，它证明了动物已经通过了相关的检疫程序，符合运输和进入市场的条件。
   • 根据《中华人民共和国动物防疫法》等相关法律法规，运输动物应当附有检疫证明，这是法律对动物运输的基本要求。

2. 检疫证未回收的合法性分析：

   • 若检疫证在运输过程中遗失或未按规定回收：这通常不构成违法行为本身，但可能违反了检疫证明的管理规定。检疫证明作为动物运输的合法凭证，其管理应当严格，以确保动物运输的合法性和安全性。如果检疫证未回收是由于疏忽或管理不善导致的，相关责任方可能需要承担一定的管理责任，但不一定直接构成违法。
   • 若检疫证被故意不回收或伪造、变造：这则可能构成违法行为。故意不回收检疫证可能意味着逃避监管，而伪造、变造检疫证则是严重的违法行为，将受到法律的严厉制裁。

3. 可能的法律后果：

   • 对于未按规定回收检疫证的行为，如果构成管理疏忽，相关责任方可能会受到行政处罚，如警告、罚款等。
   • 如果检疫证被故意不回收或涉及伪造、变造，相关责任方将可能面临更严重的法律后果，包括刑事责任。

4. 建议与措施：

   • 对于运输方：应严格遵守动物运输的相关法律法规，确保检疫证的有效性和完整性。在运输过程中，应妥善保管检疫证，并在运输结束后按规定回收或处理。
   • 对于监管部门：应加强对动物运输的监管力度，确保检疫证的有效执行和管理。对于发现的违法行为，应及时进行查处和纠正。

进一步思考：在实际操作中，动物运输车辆有检疫证但没有回收的情况可能涉及多种复杂因素。因此，在判断其合法性时，需要综合考虑相关法律法规、具体事实以及监管部门的解释和指导。如果您遇到此类问题或需要更具体的法律建议，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见。