结论是：工厂加班过长离职，在一定条件下是有补偿的。以下从不同角度为你详细分析：

一、加班过长离职补偿的法律依据

根据《劳动合同法》第三十八条的规定，用人单位有下列情形之一的，劳动者可以解除劳动合同：…（四）用人单位的规章制度违反法律、法规的规定，损害劳动者权益的；…（六）法律、行政法规规定劳动者可以解除劳动合同的其他情形。同时，根据该法第四十六条，劳动者依照本法第三十八条规定解除劳动合同的，用人单位应当向劳动者支付经济补偿。

在加班过长的情境下，如果工厂的加班制度违反了《劳动法》中关于加班时间、加班工资支付等规定，损害了劳动者的权益，那么劳动者有权依据《劳动合同法》第三十八条解除劳动合同，并依据第四十六条要求工厂支付经济补偿。

二、加班过长离职补偿的具体条件

1. 加班制度违法：工厂的加班制度必须违反了《劳动法》的相关规定。例如，根据《劳动法》第四十一条，用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，一般每日不得超过一小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过三小时，但是每月不得超过三十六小时。如果工厂的加班时间超过了这些限制，就构成了违法。

2. 损害劳动者权益：加班制度违法必须导致了劳动者的权益受到损害。这可能包括但不限于身体健康受损、休息时间被严重剥夺、加班工资未支付或支付不足等。

3. 劳动者主动解除劳动合同：在满足上述条件的情况下，劳动者需要主动向工厂提出解除劳动合同，并明确说明解除的原因是工厂的加班制度违法且损害了其权益。

三、经济补偿的计算方法

如果满足上述条件，劳动者有权要求工厂支付经济补偿。经济补偿的计算方法依据《劳动合同法》第四十七条：

• 经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，以每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。
• 六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
• 劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。
• 本条所称月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。

举例说明：假设劳动者在工厂工作了5年，月工资为5000元，且工厂的加班制度违法并损害了其权益。那么，劳动者在主动解除劳动合同后，有权要求工厂支付5个月工资（即5000元×5=25000元）作为经济补偿。

四、实际操作中的注意事项

1. 收集证据：劳动者在解除劳动合同前，应尽可能收集工厂加班制度违法的证据，如加班记录、工资条、与工厂的沟通记录等。

2. 书面通知：劳动者应向工厂发出书面通知，明确说明解除劳动合同的原因和要求支付经济补偿的诉求。

3. 协商或诉讼：如果工厂拒绝支付经济补偿，劳动者可以通过协商、调解或诉讼等途径维护自己的权益。

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