关于农村水塘承包合同由村代表几人签订是否合法的问题，结论需分情况讨论，具体分析如下：

1. 村代表签订合同的主体资格问题

根据《中华人民共和国村民委员会组织法》第二十四条，涉及村民利益的重大事项（如土地承包、集体资产处置等）需经村民会议或村民代表会议讨论决定。若水塘承包属于此类事项：

• 合法情形：若村代表是经村民会议或村民代表会议授权的合法代表（如村民委员会成员或村民代表），且签订合同的行为在授权范围内，则合同合法有效。
• 违法情形：若村代表未经合法授权（如未召开村民会议或未获得多数村民同意），擅自以个人名义或少数人名义签订合同，则可能因主体不适格导致合同无效或可撤销。

关键点：需核实村代表的授权来源（如会议记录、授权委托书等），以及合同内容是否符合村民集体意志。

2. 合同签订程序的合法性

即使村代表具备主体资格，合同签订程序仍需符合法律规定：

• 民主议定程序：根据《农村土地承包法》第五十二条，发包方将农村土地发包给本集体经济组织以外的单位或个人承包，需事先经本集体经济组织成员的村民会议三分之二以上成员或三分之二以上村民代表同意，并报乡（镇）人民政府批准。若水塘承包涉及外部主体，必须严格履行此程序。
• 公开竞标或协商：若承包方为本集体经济组织成员，程序可适当简化，但仍需公开透明，避免暗箱操作。

风险提示：若程序违法（如未公开竞标、未报批等），合同可能被认定为无效，承包方可能面临返还财产、赔偿损失等法律后果。

3. 合同内容的合法性

合同内容需符合法律强制性规定，例如：

• 承包期限：根据《农村土地承包法》第二十一条，耕地承包期为30年，草地为30-50年，林地为30-70年。水塘承包期限需参照类似规定，不得超期。
• 用途限制：承包方需按约定用途使用水塘（如养殖、灌溉），不得擅自改变用途（如填塘建房），否则可能构成违约或违法。
• 环保要求：若水塘涉及生态环境保护（如湿地、水源地），合同需明确环保责任，违反者可能承担行政或刑事责任。

建议：签订合同前，双方应共同审查合同条款，确保无违法内容。

4. 实践中的常见问题及解决

• 问题1：村代表人数不足或未达法定比例怎么办？
  解决：立即补开村民会议或村民代表会议，重新授权或追认合同效力。若无法补救，合同可能因程序违法被撤销。
• 问题2：承包方已实际使用水塘多年，合同是否有效？
  解决：根据《民法典》第一百五十二条，若承包方在知道或应当知道撤销事由之日起一年内未行使撤销权，或合同已履行多年且无重大违法，法院可能认定合同有效。

5. 给您的法律建议

1. 核实主体资格：要求村代表出示授权文件（如会议记录、村民签字表等），确认其代表村民集体的合法性。
2. 审查程序合规性：检查是否履行民主议定程序（如村民会议记录、报批文件等），确保程序无瑕疵。
3. 明确合同条款：在合同中明确承包期限、用途、环保责任、违约责任等，避免模糊表述。
4. 留存证据：保存合同原件、授权文件、付款凭证等，以备纠纷时举证。

最后提醒：农村水塘承包涉及集体利益和法律风险，建议签订合同前咨询专业律师，确保合法合规。若您有具体合同或纠纷细节，可进一步向我咨询，我会为您详细分析。