结论：干保安在监控室玩手机被扣1000块钱是否合理，不能一概而论，需要结合具体情况和相关法律法规来综合判断。以下是从不同角度进行的分析：
公司规章制度的角度：
- 如果公司有明确的规章制度，规定在监控室玩手机属于严重违反工作纪律的行为，并且明确规定了相应的处罚措施，包括扣款1000元，那么从公司内部管理的角度来看，这种扣款可能是合理的。但前提是，该规章制度必须经过合法程序制定，且内容不违反法律法规的强制性规定。
- 法律依据：根据《劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。
扣款金额合理性的角度：
- 即使公司规章制度中有相关规定，扣款金额也需要合理。根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
- 计算公式：假设保安的月工资为W元，那么每月最多可扣除的金额为\(W \times 20\%\)。如果1000元超过了这个限额，那么扣款金额就可能是不合理的。
- 举例：如果保安的月工资是3000元，那么每月最多可扣除600元作为罚款。因此，扣1000元就超过了法定限额，是不合理的。
劳动纪律与工作性质的角度：
- 监控室的工作性质通常要求保安保持高度警惕，以确保监控区域的安全。如果玩手机导致保安未能履行其职责，给公司造成了实际损失或潜在风险，那么公司有权根据规章制度进行处罚。但处罚的种类和程度应当与违规行为的性质和后果相适应。
建议：
- 如果你认为公司的扣款行为不合理，可以先与公司进行沟通协商，要求公司出示相关的规章制度和扣款依据。
- 如果沟通无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
后续行动提示：
- 在处理此类纠纷时，建议保留好相关的证据材料，如工资条、规章制度、扣款通知等，以便在需要时提供证明。
- 如果你对具体的法律程序或证据收集有疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议。