若伤者拒绝配合进行轻伤二级的重新鉴定，一般需分情况来处理：
- 重新鉴定的启动主体与程序要求
根据《公安机关办理伤害案件规定》第二十条，重新鉴定通常由办案机关（如公安机关）委托具备资质的鉴定机构进行，伤者本人并非鉴定程序的启动主体。若办案机关认为原鉴定存在程序违法、依据不足等情形，可依法启动重新鉴定，此时伤者无正当理由拒绝配合可能面临以下后果：
- 若伤者是案件当事人（如被害人），其拒绝配合可能导致办案机关依据现有证据（如原鉴定意见、病历记录等）认定伤情，但需确保程序合法性；
- 若伤者是受委托的鉴定人要求配合的对象（如需补充检查），其拒绝可能被视为“不配合鉴定”，办案机关可记录在案并说明情况，最终鉴定意见需注明该情形。
- 伤者拒绝配合的合法性边界
伤者有权对鉴定程序提出异议（如质疑鉴定机构资质、鉴定人回避等），但无正当理由拒绝配合检查、提供材料等行为可能影响其权利主张：
- 在刑事案件中，若伤者拒绝配合导致无法完成重新鉴定，办案机关可能依据《刑事诉讼法》第一百四十八条，结合其他证据（如证人证言、监控录像等）综合认定伤情；
- 在民事赔偿案件中，若伤者拒绝配合导致鉴定无法进行，法院可能根据《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》第三十一条，认定其承担举证不能的不利后果（如驳回高额赔偿请求）。
- 实务建议
- 对办案机关：应书面通知伤者配合鉴定，并告知拒绝后果；若伤者仍拒绝，可邀请见证人（如社区工作人员）到场，记录拒绝过程并附卷，确保程序合法性。
- 对伤者：若对鉴定有异议，应通过书面方式提出（如申请鉴定人回避、要求补充材料），而非直接拒绝配合；否则可能因证据不足导致权益受损。
- 对其他当事人：若伤者拒绝配合，可向办案机关申请调取其就医记录、影像资料等作为辅助证据，或申请法院委托鉴定机构依据现有材料出具意见。
总结：伤者无正当理由拒绝配合重新鉴定，不会直接导致鉴定程序终止，但可能影响伤情认定的证据效力。具体处理需结合案件性质（刑事/民事）、伤者角色（被害人/证人）及现有证据综合判断。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体案件细节。