离职补偿金的计算通常不需要扣除迟到工资，但具体是否扣除需结合实际情况判断，以下是详细分析：

1. 离职补偿金的性质与计算依据
   根据《劳动合同法》第四十七条，离职补偿金（经济补偿）的计算基数为劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资，且该工资应为“应得工资”，即扣除社保、公积金、个税等法定代扣项目前的工资总额。迟到工资属于因劳动者过错导致的工资扣减，通常不纳入“应得工资”的扣除范围，因此离职补偿金一般按全额应得工资计算，无需扣除迟到工资。

2. 迟到工资的扣除需符合法定或约定条件
   若用人单位因劳动者迟到扣减工资，需满足以下条件：

   • 规章制度合法：用人单位需在劳动合同或经民主程序制定的规章制度中明确约定“迟到扣工资”的规则（如迟到一次扣XX元），且该规则不得违反《工资支付暂行规定》中“每月扣减部分不得超过劳动者当月工资的20%”的限制；
     
   • 实际扣减合法：若规章制度未约定或约定违法（如扣减比例过高），用人单位擅自扣减迟到工资可能被认定为违法克扣工资，劳动者有权要求补发，此时离职补偿金的计算基数仍应按未扣减前的应得工资计算。

3. 例外情形：迟到工资已实际扣减且合法
   若用人单位的迟到扣减规则合法，且已实际从劳动者工资中扣除，此时离职补偿金的计算基数可能按“扣减后的实际工资”计算。但需注意：

   • 若扣减后的工资低于当地最低工资标准，用人单位需按最低工资标准补足差额后再计算补偿金；
     
   • 若劳动者对扣减有异议（如认为扣减规则违法），可先通过劳动仲裁要求补发工资，再主张离职补偿金。

建议：若用人单位以“扣除迟到工资”为由降低离职补偿金，劳动者可要求用人单位提供扣减依据（如规章制度、考勤记录等），并核对扣减是否合法。如有争议，可直接向我咨询，我会结合具体证据分析用人单位的行为是否合法，并协助您维护权益。