结论前置：公司因代理商货款未收回而扣发员工工资和提成，这一行为是否违法需分情况讨论，一般情况下，公司无权直接扣发工资，但提成扣发需视具体情况和合同约定而定。以下从不同角度详细分析：

一、关于工资扣发

1. 法律规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条：“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。”
   • 这意味着，除非有法定事由（如劳动者给用人单位造成经济损失且需赔偿、劳动者违反规章制度需罚款等，但罚款金额和程序需合法），否则用人单位不得随意扣发劳动者工资。

2. 代理商货款未收回与工资扣发的关系：

   • 代理商货款未收回，通常属于公司经营风险或商业风险范畴，不应直接转嫁到劳动者身上。
   • 除非劳动者在货款回收过程中存在故意或重大过失，且公司能证明该过失与货款未收回之间存在直接因果关系，否则公司无权因货款未收回而扣发劳动者工资。

二、关于提成扣发

1. 提成性质：

   • 提成通常属于劳动者劳动报酬的一部分，其发放条件和标准应在劳动合同或公司规章制度中明确约定。

2. 提成扣发的合法性：

   • 如果劳动合同或公司规章制度中明确约定了提成发放与货款回收挂钩：例如，约定只有货款全部回收后才能发放提成，那么在公司未能收回货款的情况下，扣发提成可能不构成违法。但需注意，这种约定应合理且不违反法律法规的强制性规定。
   • 如果劳动合同或公司规章制度中未明确约定提成发放与货款回收挂钩：或者约定不明确，那么公司无权因货款未收回而扣发劳动者提成。此时，劳动者有权要求公司按照约定或行业惯例发放提成。

3. 特殊情况：

   • 如果劳动者在货款回收过程中存在故意或重大过失，导致公司无法收回货款，且公司能证明该过失与货款未收回之间存在直接因果关系，那么公司可能有权根据内部规章制度或劳动合同约定，对劳动者的提成进行相应扣减或不予发放。但同样，这种扣减或不予发放应合理且不违反法律法规的强制性规定。

三、建议与行动

1. 审查劳动合同和公司规章制度：

   • 劳动者应首先审查自己的劳动合同和公司规章制度，了解其中关于工资和提成发放的规定。

2. 与公司协商：

   • 如果认为公司扣发工资或提成的行为不合法或不合理，劳动者可以与公司进行协商，要求公司说明扣发理由并提供相关证据。

3. 寻求法律援助：

   • 如果协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。在此过程中，建议劳动者保留好相关证据，如工资条、提成计算表、劳动合同、公司规章制度等。

最后，每个案件的具体情况都有所不同，上述分析仅供参考。如果您遇到类似问题，建议直接向我咨询，以便根据您的具体情况提供更准确的法律意见。