在二审期间公司注销，原劳动合同纠纷案件通常会被裁定终结诉讼程序，但劳动者可另行起诉公司股东承担相应责任。具体分析如下：

1. 诉讼程序终结：根据《民事诉讼法》相关规定，公司作为法人，其诉讼主体资格随注销而消灭。若公司在二审期间完成注销登记，法院将依法裁定终结原劳动合同纠纷的诉讼程序，因为此时已不存在明确的被告主体。

2. 股东责任承担：虽然诉讼程序终结，但劳动者可通过另行起诉追究公司股东责任。根据《公司法》及相关司法解释，若公司未经合法清算即注销，导致劳动者无法获得应有赔偿的，股东应在注销时承诺的债务清偿范围内承担赔偿责任。具体包括：

   • 清算义务人责任：若股东作为清算义务人未依法履行清算义务，导致公司财产贬值、流失或灭失，劳动者可要求股东在造成损失范围内承担赔偿责任。
   • 恶意注销责任：若股东在公司存在未了结债务的情况下，通过虚假清算报告骗取注销登记，劳动者可要求股东对公司债务承担连带清偿责任。

3. 实务操作建议：

   • 证据收集：劳动者应尽快收集公司注销的相关证据，包括工商注销登记材料、清算报告、股东会决议等，以证明公司注销的违法性。
   • 另行起诉：在收集证据后，劳动者可向法院提起股东损害债权人利益纠纷之诉，要求股东承担相应赔偿责任。
   • 财产保全：为防止股东转移财产，劳动者可在起诉时申请财产保全，确保后续判决能够得到有效执行。

4. 特殊情形处理：若公司注销时已依法成立清算组，并按照法定程序进行清算，劳动者可要求清算组在清算财产范围内承担赔偿责任。但实务中，此类情形较为少见，多数公司注销存在程序瑕疵。

温馨提示：公司注销并不意味着劳动者权益的终结，通过合法途径追究股东责任，仍可有效维护自身权益。若您遇到此类问题，可直接向我咨询，我将结合具体案情为您提供专业法律建议。