当劳动争议案件在诉讼过程中，公司却注销了，这确实是一个相对复杂的情况。不过，您不必担心，以下是一些详细的建议来帮助您应对这种情况：

首先，您需要明确公司注销的具体情况。公司注销分为两种情况：一种是公司在注销前已经依法进行了清算，另一种是公司未经清算即办理了注销登记。

1. 对于公司已经依法清算的情况：

   • 清算组在清算过程中，应当通知劳动者申报债权，包括工资、经济补偿金等相关费用。
   • 劳动者应及时申报债权，并在清算财产中按法定顺序受偿。
   • 如果清算财产足以清偿劳动者的债权，那么劳动者的权益可以得到保障。
   • 如果清算财产不足以清偿，劳动者在公司注销后，对于未得到清偿的部分，通常难以再向公司主张。但劳动者仍然可以保留相关证据，以备后续可能的法律追索。

2. 对于公司未经清算即注销的情况：

   • 如果公司未经依法清算即注销，导致劳动者的债权无法实现，劳动者可以根据相关法律规定，将有限责任公司的股东、股份有限公司的董事和控股股东，以及公司的实际控制人等列为被告。
   • 劳动者可以向法院提起诉讼，要求这些主体对公司债务承担相应民事责任，以维护自身合法权益。

在操作过程中，劳动者还需要注意以下几点：

• 积极收集证据：包括劳动合同、工资发放记录、工作证明等，以证明与公司的劳动关系及劳动纠纷事实。这些证据对于后续的法律追索至关重要。
• 确认公司注销的合法性：如果公司存在恶意注销等逃避债务的情形，劳动者可以通过法律途径追究相关人员的责任。
• 及时行动：劳动者在得知公司注销后，应尽快采取行动，以维护自身的合法权益。因为随着时间的推移，可能会面临更多的法律障碍和追索难度。

最后，关于劳动争议案件的诉讼费用，通常每件只需交纳10元。但如果涉及财产金额或特殊程序（如保全措施、执行等），费用可能会根据具体情况有所调整。劳动者在提起诉讼前，可以咨询当地法院或律师，以了解具体的诉讼费用和程序要求。

总之，尽管公司在诉讼过程中注销可能会给劳动者带来一些困扰和挑战，但劳动者仍然可以通过积极收集证据、确认公司注销的合法性以及及时采取行动等方式来维护自身的合法权益。