总公司的章盖在离职证明上是否违法，需分情况讨论：

1. 若总公司与分公司存在明确的隶属关系，且分公司无独立法人资格或未刻制相关印章：

   • 在这种情况下，使用总公司的章盖在离职证明上是合法的。因为分公司作为总公司的分支机构，其民事责任由总公司承担。当分公司没有独立法人资格或未刻制相关印章时，使用总公司的章来代表分公司出具离职证明，是符合法律规定的。

2. 若分公司具有独立法人资格或已刻制相关印章，且离职证明应由分公司出具：

   • 在此情形下，使用总公司的章盖在离职证明上可能构成违法或不当行为。因为分公司作为独立的法律主体，应当使用自己的印章来出具离职证明。如果错误地使用了总公司的章，可能会引发一系列法律问题，如证明的真实性、有效性受到质疑，甚至可能涉及伪造公文等违法行为。

法律背景与建议：

• 法律背景：根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，分公司不具有法人资格，其民事责任由总公司承担。但这并不意味着分公司可以随意使用总公司的印章。印章的使用应当遵循公司的内部管理规定和法律法规的要求。
• 建议：
  • 对于员工而言，如果收到的离职证明上盖的是总公司的章，而自己实际上是与分公司签订的劳动合同，有权要求分公司重新出具盖有分公司印章的离职证明。
  • 对于公司而言，应当建立健全的印章管理制度，明确印章的使用范围和审批程序，避免因印章使用不当而引发的法律风险。

可能的法律后果：

• 如果错误地使用总公司的章盖在离职证明上，且该证明被用于非法目的或造成他人损失，相关责任人员可能会承担法律责任，包括但不限于民事赔偿、行政处罚甚至刑事责任。

总结与进一步思考：

• 离职证明上的印章使用应当遵循公司的内部管理规定和法律法规的要求，确保证明的真实性和有效性。
• 如果您在离职证明或印章使用方面遇到任何问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。