结论：员工得了腰椎间盘突出后与单位协商解除劳动合同是否有补偿，需根据具体情况判断，主要包括是否构成工伤、协商解除劳动合同的具体条款以及单位是否存在过错等因素。以下从不同角度进行分析：
一、腰椎间盘突出是否构成工伤
构成工伤的情况：
- 如果腰椎间盘突出是由于工作原因导致的，例如长时间从事重体力劳动、不良的工作姿势等，且经过工伤认定程序被认定为工伤，那么员工在协商解除劳动合同时，有权依据《工伤保险条例》等相关法律法规获得相应的工伤赔偿，包括一次性伤残补助金、一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金等。
不构成工伤的情况：
- 如果腰椎间盘突出并非由于工作原因导致，或者虽然与工作有一定关系，但未经工伤认定程序认定为工伤，那么员工在协商解除劳动合同时，可能无法直接获得工伤赔偿。不过，这并不影响员工依据《劳动合同法》等相关法律法规，就协商解除劳动合同本身获得相应的经济补偿。
二、协商解除劳动合同的具体条款
双方协商一致：
- 根据《劳动合同法》第三十六条，用人单位与劳动者协商一致，可以解除劳动合同。在这种情况下，双方可以就经济补偿等事项进行协商，并达成一致意见。如果单位同意给予员工一定的经济补偿，那么员工在协商解除劳动合同时可以获得相应的补偿。
经济补偿的计算：
- 如果协商解除劳动合同符合《劳动合同法》第四十六条规定的情形，例如单位提出解除劳动合同并与劳动者协商一致解除的，单位应当向劳动者支付经济补偿。经济补偿的计算标准按照劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
三、单位是否存在过错
单位存在过错的情况：
- 如果单位在员工患病期间存在违法行为，例如未按照法律规定提供医疗期、未支付病假工资等，员工在协商解除劳动合同时，有权要求单位承担相应的法律责任，并可能获得额外的经济补偿。
单位无过错的情况：
- 如果单位在员工患病期间依法履行了相关义务，且员工主动提出协商解除劳动合同，那么单位可能无需承担额外的法律责任。不过，这并不影响双方就经济补偿等事项进行协商，并达成一致意见。
建议：
- 进行工伤认定：如果员工认为腰椎间盘突出与工作有关，建议首先进行工伤认定程序，以确定是否构成工伤。
- 协商解除劳动合同：在协商解除劳动合同时，员工应仔细阅读合同条款，确保自己的权益得到充分保障。如有需要，可以寻求专业律师的帮助，以制定合理的协商策略。
- 保留证据：员工应保留与腰椎间盘突出相关的医疗记录、工作记录等证据，以备在协商或诉讼过程中使用。
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