公司被收购时，赔偿款的承担主体需根据具体情况来确定，主要取决于收购协议的约定以及相关法律法规的规定。以下从不同角度为您详细分析：
收购协议约定：
- 在公司被收购的过程中，收购方与被收购方（即目标公司）会签订收购协议。这份协议是双方权利义务的主要依据，其中会明确约定收购价格、支付方式、支付时间以及赔偿款的承担等关键条款。
- 如果收购协议中明确规定了赔偿款的承担主体，比如由收购方承担因收购产生的某些特定赔偿，或者由被收购方承担其原有的某些债务或赔偿责任，那么双方应按照协议约定执行。
法律法规规定：
- 在没有收购协议约定或者约定不明确的情况下，赔偿款的承担可能需要根据相关法律法规来确定。
- 例如，如果收购涉及公司合并或分立，根据《公司法》的相关规定，合并或分立前的债务由合并或分立后的公司承担连带责任。这意味着，如果收购导致公司合并或分立，且因此产生赔偿款，那么合并或分立后的公司可能需要承担赔偿责任。
- 另外，如果收购过程中存在欺诈、隐瞒等违法行为，导致被收购方或第三方遭受损失，那么责任方（可能是收购方或被收购方的原管理层）可能需要承担相应的赔偿责任。
实际案例与司法实践：
- 在实际案例中，赔偿款的承担往往取决于具体的案件事实和法院的判决。法院会综合考虑收购协议的约定、相关法律法规的规定以及案件的具体情况来做出裁决。
- 例如，如果收购协议中未明确约定赔偿款的承担，但收购过程中收购方存在过错导致被收购方遭受损失，法院可能会判决收购方承担部分或全部赔偿责任。
建议：
- 在公司被收购的过程中，建议双方明确约定收购协议中的各项条款，特别是关于赔偿款的承担部分，以避免后续产生纠纷。
- 如果对收购协议中的条款存在疑问或不确定如何约定，建议咨询专业律师以获取法律意见和帮助。
- 在收购完成后，如果发生赔偿款纠纷，建议及时收集相关证据并咨询专业律师，以便通过法律途径维护自身权益。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。