结论：工伤保险公司赔钱时公司扣除医药费是否合理，需分情况讨论，关键在于医药费是否已由工伤保险基金支付或公司垫付，以及公司扣除的具体依据和程序是否合法。

1. 若医药费已由工伤保险基金支付，公司再扣除则不合理
   根据《工伤保险条例》第三十条，治疗工伤所需费用符合工伤保险诊疗项目目录、工伤保险药品目录、工伤保险住院服务标准的，从工伤保险基金支付。若工伤保险基金已全额支付医药费，公司无权再扣除，否则涉嫌违法。此时，您可要求公司返还被扣除的款项，并向当地社保部门投诉或申请劳动仲裁。

2. 若医药费由公司垫付，且公司扣除的金额未超过其实际垫付部分，则可能合理
   若公司先行垫付了医药费，后续工伤保险基金报销后，公司有权从赔偿款中扣除其垫付的金额。但需注意：

   • 公司需提供垫付医药费的凭证（如发票、支付记录等）；
     
   • 扣除金额不得超过其实际垫付部分；
     
   • 扣除程序需合法（如通过协商、劳动合同约定或公司规章制度规定，且规章制度需经民主程序制定并公示）。
     若公司无法提供垫付凭证或扣除金额不合理，您可拒绝并要求公司说明依据。

3. 若公司扣除的依据不合法（如未垫付却扣除、扣除金额超过实际垫付、未履行告知义务等），则不合理
   公司扣除医药费需有合法依据，如劳动合同约定、公司规章制度规定或双方协商一致。若公司未履行告知义务（如未在劳动合同或规章制度中明确扣除条款），或扣除金额超过其实际垫付部分，则扣除行为违法。此时，您可要求公司返还被扣除的款项，并向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

建议：

• 核实医药费的实际支付情况（是否由工伤保险基金或公司垫付）；
  
• 要求公司提供扣除医药费的依据（如垫付凭证、劳动合同条款、规章制度等）；
  
• 若公司扣除行为违法，可先与公司协商，协商不成可向当地社保部门或劳动监察部门投诉，或申请劳动仲裁维护权益。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询，我会结合具体情况为您详细解答。