结论：欠条丢失后老板扣钱是否合法，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

1. 从债务关系的本质来看：

   • 欠条是证明债务关系存在的重要证据，但它并非唯一证据。如果欠条丢失，但您能提供其他证据（如转账记录、聊天记录、证人证言等）来证明债务关系的存在以及老板确实欠您钱，那么老板扣钱的行为就是不合法的。因为债务关系的存在并不依赖于欠条这一单一证据，只要您能证明债务事实，老板就应当履行还款义务。

2. 从老板扣钱的理由来看：

   • 如果老板扣钱是因为您确实存在某些违约行为或给公司造成了损失，并且这种扣钱行为在劳动合同或公司规章制度中有明确规定，且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么老板扣钱可能是合法的。但这种情况下，扣钱的理由应当与欠条丢失无关，而是基于您自身的行为或给公司造成的损失。
   • 如果老板仅仅因为欠条丢失就扣钱，且没有其他合法理由，那么这种行为就是不合法的。因为欠条丢失并不构成老板扣钱的合法依据，老板不能因此剥夺您应得的权益。

3. 从法律程序的角度来看：

   • 如果您认为老板扣钱的行为不合法，您可以先与老板进行协商，尝试通过沟通解决问题。
   • 如果协商无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁，甚至提起诉讼来维护自己的合法权益。在法律程序中，您需要提供充分的证据来证明债务关系的存在以及老板扣钱的不合法性。

建议：

• 在欠条丢失后，您应尽快收集其他能够证明债务关系的证据，如转账记录、聊天记录等，以备不时之需。
• 如果与老板协商无果，您可以考虑寻求法律援助或咨询专业律师（即向我咨询），以便更好地了解自己的权益和维权途径。
• 在整个过程中，您应保持冷静和理性，避免采取过激行为或言语攻击，以免加剧矛盾或影响自己的维权效果。