结论：员工旷工时，用人单位在合法合规的前提下，可以依据规章制度扣除相应工资，但扣除的金额和方式必须合理且符合法律规定，不可以额外扣工资（即超出合理范围或法定限度的扣款）。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与原则
《中华人民共和国劳动法》第五十条：明确规定了工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这奠定了工资支付的基本原则，即用人单位不得随意扣减员工工资。
《工资支付暂行规定》第十六条：虽然主要规定的是因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失时的赔偿问题，但也间接说明了扣减工资需有合法依据，且每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。这一规定同样适用于旷工扣工资的情形，即扣减需有限度。
二、旷工扣工资的具体操作与限制
合法规章制度：用人单位应在内部规章制度中明确规定旷工的定义、后果及处理方式，包括是否扣工资、扣多少等。这些规章制度必须内容合法、程序合法，且已经向劳动者公示或告知。例如，规章制度应当经过职工讨论，确保不违反法律法规的规定，并保障劳动者的合法权益。
扣薪标准与依据：如果用人单位依法制定并向劳动者公示的规章制度明确规定旷工属于违纪行为，且规定了相应合理的扣薪标准（如旷工一天扣多少工资，且该标准不超过当日工资的合理比例），那么用人单位可以依据该规章制度扣工资。但扣薪标准应合理且明确，不能采取不合理的扣除方式，如“旷一天罚三天”等，这属于额外扣工资，是不合法的。
扣薪计算与限度：旷工期间的工资可以按照旷工的天数乘以员工的日工资来计算，并予以扣除。但扣除的金额不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。这是法律对扣减工资的明确限制，用人单位必须遵守。
三、员工权益保护与用人单位注意事项
员工异议权：员工在遭遇不合理的旷工扣工资时，有权向用人单位提出异议，并要求用人单位给出合理的解释和依据。如果用人单位无法提供合法合规的扣减依据，员工有权要求返还多扣除的部分。
用人单位避免滥用权利：用人单位不得随意以旷工为由克扣员工工资，必须严格按照规章制度和法律法规执行。规章制度的内容必须合理，不能过于严苛或不合理，否则可能被视为不合法，从而不能作为扣钱的依据。
关注特殊情况：对于因不可抗力或特殊原因导致的旷工，用人单位应酌情处理，避免一刀切的做法。例如，员工因突发疾病或家庭紧急情况无法及时请假而旷工的，用人单位可以考虑不扣减工资或给予一定的宽限期。
四、实际案例与建议
假设某公司规章制度规定旷工一天扣发当日工资的50%，且该制度已经过民主程序制定并向员工公示。如果员工旷工一天，公司可以按照该规定扣发其当日工资的50%，但不得超过其当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。如果公司扣减的金额超出了这个限度，就属于额外扣工资，是不合法的。
建议：用人单位在处理旷工问题时，应首先确保自己的规章制度合法、合理，并严格按照法律规定进行扣钱处理。同时，员工也应遵守公司的规章制度，避免无故旷工给公司和自己带来不必要的麻烦。在出现争议时，双方应本着友好协商的原则进行解决，以维护良好的劳动关系和工作环境。如果无法协商解决，可以寻求法律途径来维护自己的合法权益。
总之，旷工扣工资需在合法合规的前提下进行，且扣除的金额和方式必须合理且符合法律规定。用人单位不得额外扣工资或采取不合理的扣除方式。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。