结论：员工平时请假，公司用周末加班抵消是否合法，需根据具体情况判断。若公司确保员工每周至少休息一天，调休安排合理且符合劳动法规，同时不损害员工加班调休或加班工资的权益，则可能合法；反之，则不合法。
一、周末的法律地位与调休原则
周末是劳动者的法定休息日，根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位应保证劳动者每周至少休息一日。在计算工资时，周末的工资是劳动者应得的合法权益，不应因请假而被直接扣除。公司在对工作时间和休假进行统筹安排时，需遵守劳动法规，确保调休安排合理且合法。
二、正常工作日请假与周末调休抵扣的合法性分析
合法情况：
- 如果员工请的是普通事假等正常工作日的假期，公司安排在后续周末进行调休抵扣，同时确保员工每周至少休息一天，并支付正常工作时间的工资，这种做法在劳动合同或公司规章制度有明确规定，且不违反法律法规的情况下，通常是合法的。这属于公司对工作时间和休假的合理统筹安排。
不合法情况：
- 如果公司过度利用调休来抵扣员工请假，导致员工实际休息时间不足或工资受损，比如未支付正常工作时间的工资，或者调休后员工每周休息时间少于一天，则可能构成违法。
- 操作建议：公司在实施调休抵扣时，应明确告知员工调休的具体安排，并确保调休后员工的休息时间符合法律规定。员工在接受调休安排时，也应了解自己的权益，避免被不合理地剥夺休息时间。
三、周末加班与请假抵扣的特殊情况
平时加班与周末加班：
- 平时加点（即工作日延长工作时间）不能用调休替代加班费，必须支付不低于工资150%的加班工资。
- 周末加班可以安排调休，但如果公司将员工原本应得的周末加班调休用来抵扣请假，则损害了员工的权益。比如，员工周末加班后应享有调休或加班工资，公司却用这部分调休来抵扣员工平时的事假，这属于不合法行为。
法定节假日加班：
- 法定节假日加班不能用调休抵扣，必须支付不低于工资300%的加班工资。若公司将法定节假日加班的调休用于抵扣员工请假，则严重违反了劳动法律法规。
四、劳动者的权益保护与救济途径
权益保护：
- 劳动者有权要求公司按照法律规定支付工资和安排休息时间。如果公司违反劳动法规，劳动者可以与公司进行协商沟通，要求纠正不当行为。
救济途径：
- 协商不成时，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉，请求查处公司的违法行为。
- 劳动者还可以申请劳动仲裁或提起诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。在申请劳动仲裁或提起诉讼时，劳动者需要提供相关证据，如劳动合同、工资条、请假记录、调休安排等，以证明公司的违法行为。
总结与建议：公司在处理员工请假与周末调休抵扣问题时，应严格遵守劳动法规，确保员工的休息时间和工资待遇不受损害。劳动者在遇到相关争议时，也应积极维护自己的合法权益，通过合法途径寻求救济。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。