针对您提出的“合同到期了员工请假了怎么办”这一问题，我们需要从多个角度进行详细分析和解答，以确保既保障员工的合法权益，又维护用人单位的管理权利。
一、合同期限与医疗期的关系
首先，要明确的是，如果员工在合同到期前请病假，并且处于法定医疗期内，根据《劳动合同法》的相关规定，劳动合同将自动延续至医疗期结束时终止。这意味着，即使合同原本到期，只要员工还在医疗期内，合同就会继续有效，用人单位不能单方面终止合同。
二、医疗期的确定与待遇
医疗期的长短是根据员工的实际工作年限和在本单位的工作年限来确定的，具体标准如下：
- 实际工作年限十年以下，本单位工作年限五年以下为3个月；五年以上为6个月。
- 实际工作年限十年以上，本单位工作年限五年以下为6个月；五年以上十年以下为9个月；十年以上十五年以下为12个月；十五年以上二十年以下为18个月；二十年以上为24个月。
在医疗期内，用人单位有义务支付员工病假工资或疾病救济费，标准不低于当地最低工资标准的80%。同时，员工需要提供正规医疗机构出具的病假证明，以证明其病假的真实性和合理性。
三、用人单位的权利与义务
义务方面：
- 用人单位需要按照规定支付员工在医疗期内的病假工资或疾病救济费。
- 在医疗期内，除非员工存在严重过错（如违反公司规章制度等），否则用人单位不能以合同到期为由终止劳动合同。
权利方面：
- 用人单位有权要求员工提供病假证明等相关材料，并进行核实。如果发现虚假病假，用人单位可以按规定处理，甚至解除劳动合同。
- 医疗期结束后，如果员工不能从事原工作或另行安排的工作，用人单位可以提前三十日以书面形式通知或额外支付一个月工资后解除劳动合同，但需要支付经济补偿。
四、员工的权利与义务
权利方面：
- 员工在医疗期内享有病假工资、劳动合同延续等权益。
- 如果医疗期满后被解除劳动合同，员工有权按工作年限获得经济补偿。
义务方面：
- 员工需要按照公司规章制度办理病假手续，提供真实有效的病假证明等材料。
- 在病假期间及医疗期满后，员工需要积极配合用人单位的管理和工作安排。
五、实际操作建议
- 查阅公司规章制度：首先，用人单位和员工都应该了解公司关于请病假的具体规定，包括请假流程、所需证明等。
- 及时沟通：员工请病假时，用人单位应及时与员工沟通，了解其病情及医疗期情况，以便做出合理安排。
- 合规处理：用人单位在处理员工的病假申请及合同延续事宜时，应严格遵守劳动法律法规及公司规章制度，确保合规性。
- 保留证据：用人单位应妥善保存员工的病假证明、医疗期记录等相关证据，以备不时之需。
综上所述，当员工合同到期时请病假，用人单位和员工都需要根据劳动法律法规和公司规章制度进行合规处理。用人单位应确保员工的合法权益得到保障，同时维护自身的管理权利；员工则应遵守病假规定，积极配合用人单位的管理和工作安排。如有任何疑问或争议，建议及时咨询专业律师或劳动监察部门以获取更具体的法律建议和帮助。