结论：负责双方股权转让的律师，在后续是否可以代理一方进行诉讼，这主要取决于律师是否违反了相关的职业道德和执业纪律规范，以及是否存在可能影响公正代理的情形。
详细分析：
职业道德与执业纪律：
- 律师在执业过程中，必须遵守职业道德和执业纪律规范，其中就包括了对律师代理行为的限制。一般来说，如果律师在之前已经为双方提供了股权转让的法律服务，那么在后续的诉讼中，如果该诉讼与之前的股权转让有直接关联，且律师的代理可能涉及对之前服务的评价或解释，那么律师代理一方进行诉讼可能会引发利益冲突或公正性质疑。
- 具体来说，如果律师在股权转让过程中已经了解了双方的商业秘密、谈判策略等敏感信息，那么在后续的诉讼中，这些信息可能会被一方利用来对抗另一方，从而损害另一方的利益。因此，为了避免这种利益冲突，律师通常不会在后续代理与之前服务直接相关的诉讼。
公正性与利益冲突：
- 公正性是律师执业的核心原则之一。如果律师在后续代理一方进行诉讼时，存在可能影响其公正判断的因素，如之前与另一方的合作关系、对另一方情况的了解等，那么这种代理行为就可能被视为不公正的。
- 利益冲突也是律师需要避免的重要情形。如果律师在代理一方进行诉讼时，其个人利益或之前与另一方的关系可能影响其代理行为，那么这种代理就可能构成利益冲突，从而违反职业道德和执业纪律规范。
实际操作中的考虑：
- 在实际操作中，如果律师确实希望在后续代理一方进行诉讼，那么其需要仔细评估是否存在利益冲突或公正性质疑的情形。如果存在这些情形，律师应该拒绝代理或采取其他措施来消除这些影响。
- 另外，律师还需要考虑客户的需求和期望。如果客户希望律师在后续代理其进行诉讼，并且律师认为这种代理不会违反职业道德和执业纪律规范，那么律师可以与客户进行充分沟通，明确代理的范围和限制，以确保代理行为的合法性和公正性。
建议：
- 如果您是股权转让的一方，并且希望律师在后续代理您进行诉讼，那么您应该与律师进行充分沟通，了解律师是否愿意并能够代理您的诉讼，以及代理过程中可能存在的风险和限制。
- 如果您是律师，并且之前已经为双方提供了股权转让的法律服务，那么在后续是否代理一方进行诉讼时，您应该仔细评估是否存在利益冲突或公正性质疑的情形，并遵守职业道德和执业纪律规范的要求。
总结：负责双方股权转让的律师在后续是否可以代理一方进行诉讼，并没有一个绝对的答案。这主要取决于律师是否违反了相关的职业道德和执业纪律规范，以及是否存在可能影响公正代理的情形。因此，在实际操作中，律师和客户都需要根据具体情况进行仔细评估和决策。如果您有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。