结论：员工自动离职且未完成工作交接时，奖金是否可以扣除需分情形判断，并非绝对可以或不可以扣除。以下从不同角度详细分析：

一、奖金性质与发放条件是关键

1. 若奖金属于“已确定发放且无附加条件”
   根据《关于工资总额组成的规定》，奖金属于工资范畴。若奖金已实际发放，且劳动合同、公司制度中未约定“离职需退还奖金”或“未完成交接可扣奖金”等条款，则公司无权单方面扣除。
   示例：员工每月固定发放的绩效奖金，或项目完成后已发放的提成奖金，离职时公司不得以未交接为由扣回。

2. 若奖金属于“附条件发放”
   若奖金发放条件未成就（如需完成全年业绩、在职满一定期限等），或公司制度明确规定“离职时未完成交接可扣奖金”，则公司可能合法扣除。
   法律依据：

   • 《劳动合同法》第三条：劳动者需履行劳动合同约定的义务，包括工作交接。
     
   • 《工资支付暂行规定》第十六条：若员工因失职给公司造成损失，公司可要求赔偿，但每月扣款不得超过工资的20%，且剩余工资不得低于最低工资标准。
     示例：公司规定“年度奖金需在职至次年3月发放，且需完成工作交接”，员工在2月自动离职且未交接，公司可依据制度不发放奖金。

二、公司制度合法性是前提

1. 制度需经民主程序制定并公示
   若公司以“未完成交接”为由扣奖金，需确保相关制度已通过职工代表大会讨论、与工会协商，并向员工公示（如签字确认、培训记录等）。否则，制度可能被认定为无效。
   法律依据：

   • 《劳动合同法》第四条：用人单位制定规章制度需经民主程序，并告知劳动者。

2. 扣款需合理且程序合规
   即使制度合法，扣款金额也需与损失相当。若公司仅以“未交接”为由全额扣奖金，可能被认定为违法克扣工资。
   示例：员工未交接导致公司损失5000元，但奖金为2万元，公司仅能扣5000元，而非全部奖金。

三、员工与公司的应对建议

1. 对员工：

   • 保留证据：保存奖金发放记录、劳动合同、公司制度等文件，证明奖金性质及发放条件。
     
   • 协商解决：若公司扣款不合理，可先与公司协商，要求说明扣款依据。
     
   • 维权途径：若协商无果，可向当地劳动监察大队投诉，或申请劳动仲裁，主张公司支付被扣奖金。

2. 对公司：

   • 完善制度：在劳动合同或规章制度中明确奖金发放条件、离职处理规则（如“未完成交接可扣不超过XX%的奖金”）。
     
   • 依法操作：扣款前需通知员工并说明理由，确保扣款后工资不低于最低标准。
     
   • 留存证据：保存员工未交接的证据（如交接清单、损失证明等），以备争议时使用。

四、典型案例参考

• 支持扣除的案例：某公司规定“项目奖金需项目验收且员工在职满3个月后发放”，员工在项目验收前离职且未交接，法院认定公司无需支付奖金。
  
• 不支持扣除的案例：某公司以“未完成全年业绩”为由扣除员工已发的季度奖金，但合同未约定离职需退回奖金，最终法院判决公司败诉。

总结：员工自动离职未交接时，奖金能否扣除需结合奖金性质、发放条件及公司制度合法性综合判断。建议双方优先协商，必要时通过法律途径解决争议。如有进一步问题，可直接向我咨询。